RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SSX3Q99909 188 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CHIAQ9BZP6 476 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR51J1Q9H342 316 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GHITMQ9H3K2 345 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FBXL15Q9H469 300 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MGAT4CQ9UBM8 478 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GAB2Q9UQC2 676 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 WNK2Q9Y3S1 2297 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.82□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C7orf66A4D0T2 115 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RNF212BA8MTL3 300 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM25EA8MYX2 175 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SMLR1H3BR10 107 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FCN1O00602 326 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SHOXO15266 292 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A17O43808 307 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 IGLV2-23P01705 113 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 APOA2P02652 100 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OPN1MWP04001 364 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 IL5P05113 134 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 APELAP0DMC3 54 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OPN1MW2P0DN77 364 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OPN1MW3P0DN78 364 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM11P17152 192 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CXCL3P19876 107 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 UCP1P25874 307 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CEACAM3P40198 252 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ECI1P42126 302 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MECP2P51608 486 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TAS2R31P59538 309 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ID3Q02535 119 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PJVKQ0ZLH3 352 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CATR1Q13166 79 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C10orf55Q5SWW7 151 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GGNBP1Q5YKI7 109 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LPCAT3Q6P1A2 487 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZRM9 215 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF695Q8IW36 515 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CADM3Q8N126 398 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ZBTB34Q8NCN2 500 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR11H7Q8NGC8 314 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR146Q96CH1 333 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MALSU1Q96EH3 234 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SEC22AQ96IW7 307 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HARBI1Q96MB7 349 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM222Q9H0R3 208 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ESM1Q9NQ30 184 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 WASHC3Q9Y3C0 194 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCA1O95477 2261 aa4.81□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC01548A6NM66 108 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SSNA1O43805 119 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC22A5O76082 557 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR2F2O95006 317 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SERPINE2P07093 398 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FBP1P09467 338 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 S100GP29377 79 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 AKR1C2P52895 323 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GNB1P62873 340 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 PSG5Q15238 335 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MMDQ15546 238 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MSMO1Q15800 293 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 RTL8BQ17RB0 113 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4A47Q6IF82 309 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 C19orf35Q6ZS72 473 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LGI3Q8N145 548 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR8H3Q8N146 312 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8N6K4 173 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MINDY2Q8NBR6 621 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 DMBX1Q8NFW5 382 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4S2Q8NH73 311 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 MITD1Q8WV92 249 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GALNT14Q96FL9 552 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 OR10C1Q96KK4 312 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 FANCD2OSQ96PS1 177 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 SLC25A33Q9BSK2 321 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM140Q9NV12 185 aa4.8□□□□□ -1.64
CAPNS1-208ENST00000589162 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
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