RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ST8SIA3O43173 380 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TGFAP01135 160 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CD1BP29016 333 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 WFDC11Q8NEX6 87 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 OR11H4Q8NGC9 324 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF5Q99942 180 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 VPS13CQ709C8 3753 aa25.05■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV1-69P01742 117 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LGALS7P47929 136 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 ID3Q02535 119 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 GPR157Q5UAW9 335 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 PRSS54Q6PEW0 395 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM65Q6PI78 240 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 Q6ZRM9 215 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HARBI1Q96MB7 349 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 POMT1Q9Y6A1 747 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CREBBPQ92793 2442 aa25.04■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MBPP02686 304 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 LYL1P12980 280 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM140Q9NV12 185 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HILPDAQ9Y5L2 63 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 HECTD1Q9ULT8 2610 aa25.03■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRD5 423 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRF3 423 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PRM7 423 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SAA4P35542 130 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CYB5R2Q6BCY4 276 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 VSTM2AQ8TAG5 236 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SCGB1D2O95969 90 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 S100A10P60903 97 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 RPS16P62249 146 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX2Q16385 188 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 CFHR4Q92496 578 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 BET1LQ9NYM9 111 aa25.02■■□□□ 1.6
CAPNS1-206ENST00000588815 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TRAV40A0A0B4J280 105 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 K7EPK0 472 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TIMM23O14925 209 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DEDDO75618 318 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 BPIFB3P59826 476 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 AARDQ4LEZ3 155 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4A47Q6IF82 309 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FOXRED2Q8IWF2 684 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RNF126Q9BV68 326 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MBD2Q9UBB5 411 aa25.01■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SSX9Q7RTT3 188 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF546Q86UE3 836 aa25■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4A16Q8NH70 328 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR4A5Q8NH83 315 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ABCA1O95477 2261 aa24.99■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 H0YIZ8 118 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 WRBO00258 174 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FGF2P09038 288 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR9G9P0C7N8 305 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 VMA21Q3ZAQ7 101 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF429Q86V71 674 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP24.98■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 E5RGE8 158 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 MED6O75586 246 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 VENTXO95231 258 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2KP61086 200 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RELBQ01201 579 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PIP4P2Q8N4L2 257 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 AJUBAQ96IF1 538 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 HSPB7Q9UBY9 170 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 NSG2Q9Y328 171 aa24.97■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
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CAPNS1-206ENST00000588815 BRS3P32247 399 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR52E5Q8NH55 327 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFSF18Q9UNG2 199 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC168Q8NDH2 2452 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TNCP24821 2201 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 TNFRSF9Q07011 255 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DYNAPQ8N1N2 210 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 DCUN1D4Q92564 292 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 FKBP11Q9NYL4 201 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 OR5AC2Q9NZP5 309 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 PRNDQ9UKY0 176 aa24.96■■□□□ 1.59
CAPNS1-206ENST00000588815 C15orf61A6NNL5 157 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 UPK2O00526 184 aa24.95■■□□□ 1.58
CAPNS1-206ENST00000588815 ARPC5O15511 151 aa24.95■■□□□ 1.58
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