RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 BAGE3Q86Y29 109 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 BAGE2Q86Y30 109 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM178AQ8NBL3 297 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CT55Q8WUE5 264 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TBX15Q96SF7 602 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GGTLC1Q9BX51 225 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TTTY12Q9BZ98 90 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PARD6AQ9NPB6 346 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 DEPPQ9NTK1 212 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 UQCR10Q9UDW1 63 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PRNDQ9UKY0 176 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 LSM4Q9Y4Z0 139 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 NCKAP5O14513 1909 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MYO9BQ13459 2157 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PRE2 83 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 F2RL2O00254 374 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 FCN1O00602 326 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RHBDL1O75783 438 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ARL14EPLP0DKL9 152 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CCL4P13236 92 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 BTF3P20290 206 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 NPY1RP25929 384 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CD82P27701 267 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 DUTP33316 252 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GNG4P50150 75 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS12P56730 875 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CX3CL1P78423 397 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ARG2P78540 354 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PMP22Q01453 160 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 Q0VFX4 171 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF718Q3SXZ3 478 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SPATA46Q5T0L3 261 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TREML4Q6UXN2 200 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MDP1Q86V88 176 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PRR18Q8N4B5 295 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM251Q8N6I4 163 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 Q8N7P7 452 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1L1Q8NH94 360 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF488Q96MN9 340 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GPHA2Q96T91 129 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 S1PR3Q99500 378 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZFP30Q9Y2G7 519 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SOX21Q9Y651 276 aaPredicted RBP6.44□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 C15orf61A6NNL5 157 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 C17orf98A8MV24 154 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 PRSS46E5RG02 174 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 INS-IGF2F8WCM5 200 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GFRA3O60609 400 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RAMP3O60896 148 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 LILRA1O75019 489 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF253O75346 499 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV3-9P01782 118 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 AMY1AP04745 511 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 CFIP05156 583 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SP1P08047 785 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 OR4A8P0C604 315 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 NPPCP23582 126 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ADMP35318 185 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RPL31P62899 125 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RTP5Q14D33 572 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MBNL2Q5VZF2 373 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 Q6ZT83 130 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 MMD2Q8IY49 270 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 SLC24A4Q8NFF2 622 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 STXBP6Q8NFX7 210 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 OR1L6Q8NGR2 347 aa6.43□□□□□ -1.38
CAPNS1-202ENST00000586851 GATAD1Q8WUU5 269 aa6.43□□□□□ -1.38
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