RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578861.5

SNX11-205, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

TSL 4

Gene SNX11, Length 571 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-205ENST00000578861 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.66□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 A0A0B4J203 849 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 TRDCB7Z8K6 153 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 BET1O15155 118 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 MPPED1O15442 326 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 IGLV2-23P01705 113 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 PRH1P02810 166 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 CRYGBP07316 175 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 CD81P60033 236 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 CBX3Q13185 183 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 ZNF846Q147U1 533 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 TNXAQ16473 311 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 IDO2Q6ZQW0 420 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 SPARTQ8N0X7 666 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 Q8N402 240 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 SNAPC3Q92966 411 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 TMEM203Q969S6 136 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 PECRQ9BY49 303 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 WFDC10AQ9H1F0 79 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 OR2D2Q9H210 308 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.65□□□□□ -1.34
SNX11-205ENST00000578861 SHISA3A0PJX4 238 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PTGES3LE9PB15 166 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 CDK2AP2O75956 126 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 TPPPO94811 219 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 OR2A4O95047 310 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 CD7P09564 240 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PSMB9P28065 219 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 TMEM50BP56557 158 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 CLDN12P56749 244 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 RAB11BQ15907 218 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 GUCA2BQ16661 112 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 RTL8BQ17RB0 113 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 IGSF11Q5DX21 431 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 DEFB125Q8N687 156 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 DYNLRB2Q8TF09 96 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 FBLIM1Q8WUP2 373 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 ACOT12Q8WYK0 555 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 MAFIPQ8WZ33 124 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 USMG5Q96IX5 58 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 GFI1Q99684 422 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 NEURL2Q9BR09 285 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 MND1Q9BWT6 205 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 AKIP1Q9NQ31 210 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 SDHAF2Q9NX18 166 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PEMTQ9UBM1 199 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 HSF4Q9ULV5 492 aa6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 ZNF785A8K8V0 405 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 BMPR1BO00238 502 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 SLC17A2O00624 439 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 FABP7O15540 132 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 CDK1P06493 297 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 UCHL1P09936 223 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 OR9G9P0C7N8 305 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 GSTT2P0CG29 244 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 GSTT2BP0CG30 244 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 RBMY1CP0DJD4 496 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 INAFM2P0DMQ5 153 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 EDN2P20800 178 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 RHOGP84095 191 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 ATP5G2Q06055 141 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PLA2G7Q13093 441 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 SPHARQ15513 63 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 MED22Q15528 200 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PRSS8Q16651 343 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 TMEM177Q53S58 311 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PLAC9Q5JTB6 97 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 LIPKQ5VXJ0 399 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 OR4A4PQ8NGN8 299 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 C5orf30Q96GV9 206 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 TMEM68Q96MH6 324 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 SRD5A3Q9H8P0 318 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.63□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 A0A075B6Q4 140 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 C16orf90A8MZG2 172 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 OR11H12B2RN74 326 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 PPP5D1E7EU14 171 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 J3QRK9 145 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 M0R2N4 97 aa6.62□□□□□ -1.35
SNX11-205ENST00000578861 RTL8CO15255 209 aa6.62□□□□□ -1.35
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