RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000565638.1

N4BP1-205, Transcript of NEDD4 binding protein 1, human

TSL 5

Gene N4BP1, Length 296 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
N4BP1-205	ENST00000565638	FAM212B	Q9NTI7	297 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZFP57	Q9NU63	452 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RNF150	Q9ULK6	438 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PLXNB1	O43157	2135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TNC	P24821	2201 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CCDC160	A6NGH7	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	LINC00473	A8K010	186 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638		H3BUA1	57 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	GABARAP	H6UMI1	98 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CRYZL1	O95825	349 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TSPAN15	O95858	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGLV2-14	P01704	120 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	IGLV2-23	P01705	113 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CD28	P10747	220 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PTHLH	P12272	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	AADAC	P22760	399 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CNTFR	P26992	372 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HRH1	P35367	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	UCP3	P55916	312 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TAS2R19	P59542	299 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	UBE2K	P61086	200 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TMEM267	Q0VDI3	215 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PSG5	Q15238	335 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	AKIRIN2	Q53H80	203 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RNASE10	Q5GAN6	216 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	LPCAT3	Q6P1A2	487 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TMEM17	Q86X19	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SNX29P2	Q8IUI4	249 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CMTM1	Q8IZ96	169 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CADM3	Q8N126	398 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TEX45	Q8NA69	505 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	POC5	Q8NA72	575 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR6F1	Q8NGZ6	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MYOZ3	Q8TDC0	251 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TCTEX1D2	Q8WW35	142 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FCAMR	Q8WWV6	532 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MISP3	Q96FF7	219 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	NOL4L	Q96MY1	436 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FBXL15	Q9H469	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SEPSECS	Q9HD40	501 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	COMMD9	Q9P000	198 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	METTL1	Q9UBP6	276 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.62	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TCRBV4S1A1T	A0A5B7	111 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SLC25A17	O43808	307 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FCGR3B	O75015	233 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	BRI3	O95415	125 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	DUS4L	O95620	317 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CA2	P00918	260 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	HRAS	P01112	189 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CD74	P04233	296 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CRYGB	P07316	175 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SAA1	P0DJI8	122 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PSMB8	P28062	276 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CD40LG	P29965	261 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	PPIF	P30405	207 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	FXYD4	P59646	89 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TSPAN5	P62079	268 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	CX3CL1	P78423	397 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	NDP	Q00604	133 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	RAB32	Q13637	225 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MEF2D	Q14814	521 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	POU2AF1	Q16633	256 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	ZNF329	Q86UD4	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MMD2	Q8IY49	270 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	OR4A5	Q8NH83	315 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.61	□□□□□ -1.67
N4BP1-205	ENST00000565638	C4orf3	Q8WVX3	66 aa		4.61	□□□□□ -1.67

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