RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 B4GALT1P15291 398 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MAVSQ7Z434 540 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ARL17AQ8IVW1 177 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GLMPQ8WWB7 406 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD17AQ96GS6 310 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SMIM8Q96KF7 97 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FAM60AQ9NP50 221 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZAR1LA6NP61 321 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10G9Q8NGN4 311 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PRO3102Q9H379 93 aa5.43□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 DKK4Q9UBT3 224 aa5.43□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 FAM106AQ4KMX7 169 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 KIR2DL5AQ8N109 375 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 CRIPAKQ8N1N5 446 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 ZPLD1Q8TCW7 415 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 SFT2D2O95562 160 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 EFEMP2O95967 443 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 SYNGR3O43761 229 aa5.42□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 MORN2Q502X0 79 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF793Q6ZN11 406 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A42Q86VD7 318 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 OR10G8Q8NGN5 311 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF519Q8TB69 540 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM255BQ8WV15 326 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 Q96M85 177 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 HIGD1AQ9Y241 93 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SNURFLB1AK76 121 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 KLK2P20151 261 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 IRF3Q14653 427 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 OR4A5Q8NH83 315 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 WFDC12Q8WWY7 111 aa5.41□□□□□ -1.54
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PTPRB-210ENST00000551525 MS4A6AQ9H2W1 248 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM242Q9NWH2 141 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FGF16O43320 207 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TUSC2O75896 110 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 B3GALT4O96024 378 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 APCSP02743 223 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 FAHP16930 419 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ALOX5APP20292 161 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PRDX2P32119 198 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SLC25A30Q5SVS4 291 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM101Q96IK0 257 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 COMMD5Q9GZQ3 224 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRB-210ENST00000551525 SIRPDQ9H106 197 aa5.41□□□□□ -1.54
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