RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543087.5

TSG101-208, Transcript of tumor susceptibility 101, human

TSL 3

Gene TSG101, Length 714 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TSG101-208	ENST00000543087	TINAGL1	Q9GZM7	467 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	ZNF430	Q9H8G1	570 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	RANGRF	Q9HD47	186 aa	Predicted RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	TAS2R8	Q9NYW2	309 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	TENM3	Q9P273	2699 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	SLC22A5	O76082	557 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	PRH1	P02810	166 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	AADAC	P22760	399 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	FCGR2C	P31995	323 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	SCAND1	P57086	179 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	HOGA1	Q86XE5	327 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	SRSF12	Q8WXF0	261 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	RSRP1	Q9BUV0	290 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	ELOVL1	Q9BW60	279 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	AUNIP	Q9H7T9	357 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	CCL28	Q9NRJ3	127 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TSG101-208	ENST00000543087	TNFSF12	O43508	249 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	AIRE	O43918	545 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	RBMXL2	O75526	392 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	TRBV12-3	P01733	135 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR9G9	P0C7N8	305 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	GP9	P14770	177 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ZP3	P21754	424 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	RPS19	P39019	145 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	CDK10	Q15131	360 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	C10orf55	Q5SWW7	151 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ADAD2	Q8NCV1	583 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	HSD17B10	Q99714	261 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	PEF1	Q9UBV8	284 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		10.02	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087		A0A087WXM4	84 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087		A0A0A6YYH2	397 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	HMX3	A6NHT5	357 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087		A6NJ64	397 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SYNJ2BP	P57105	145 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	BRWD1-AS2	P59051	145 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	FXYD4	P59646	89 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	EIF4EBP1	Q13541	118 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	DYRK1A	Q13627	763 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SSX9	Q7RTT3	188 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	MMD2	Q8IY49	270 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR4S2	Q8NH73	311 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	YIPF6	Q96EC8	236 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087		U3KQK5	164 aa		10.01	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	XRCC3	O43542	346 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR2A4	O95047	310 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	PPY	P01298	95 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	RHOG	P84095	191 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	KLF5	Q13887	457 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ZNF343	Q6P1L6	599 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ANKRD13B	Q86YJ7	626 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SAMD12	Q8N8I0	201 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	USMG5	Q96IX5	58 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR2A7	Q96R45	310 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SPIN2A	Q99865	258 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SPIN2B	Q9BPZ2	258 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	VCX3A	Q9NNX9	186 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	IFT46	Q9NQC8	304 aa		10	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SULT1C2	O00338	296 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	CREBL2	O60519	120 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	KBTBD11	O94819	623 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	TNFAIP8	O95379	198 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	BRI3	O95415	125 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	MYOD1	P15172	320 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	CBX5	P45973	191 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ZNF45	Q02386	682 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ATP5G2	Q06055	141 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	RPEL1	Q2QD12	228 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	C19orf35	Q6ZS72	473 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	SNAPC3	Q92966	411 aa		9.99	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	DPPA5	A6NC42	116 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087		E7EUB6	86 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	OR2J3	O76001	311 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	HRAS	P01112	189 aa		9.98	□□□□□ -0.81
TSG101-208	ENST00000543087	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81

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