RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541770.1

CLSTN3-212, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 3

Gene CLSTN3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-212ENST00000541770 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC35D1Q9NTN3 355 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.85□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 NUDT19A8MXV4 375 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 DISC1C4P0D8 188 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 H7C2Y5 167 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 GPR31O00270 319 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 NBR2O15453 112 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SPDEFO95238 335 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 IGKV1-16P04430 117 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 LGALS7P47929 136 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 F2RL1P55085 397 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 LINC00205P59089 165 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CATR1Q13166 79 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CBX3Q13185 183 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 KLF9Q13886 244 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 MMDQ15546 238 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TMEM177Q53S58 311 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CASC10Q5T4H9 136 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 KCTD9Q7L273 389 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 MUC7Q8TAX7 377 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PRR25Q96S07 402 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PRRT1Q99946 306 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 PALMDQ9NP74 551 aa6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 LIN7CQ9NUP9 197 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CLSTN3-212ENST00000541770 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 S100GP29377 79 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 KIR2DS2P43631 304 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 BRWD1-AS2P59051 145 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RND3P61587 244 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RPS16P62249 146 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 BAK1Q16611 211 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF329Q86UD4 541 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 OR51S1Q8NGJ8 323 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 OR4S2Q8NH73 311 aa6.83□□□□□ -1.32
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CLSTN3-212ENST00000541770 ZFAND1Q8TCF1 268 aa6.83□□□□□ -1.32
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CLSTN3-212ENST00000541770 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RITA1Q96K30 269 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 CCDC32Q9BV29 185 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 HRASLSQ9HDD0 168 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 KIAA1456Q9P272 454 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.83□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 PSMB11A5LHX3 300 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RRHO14718 337 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SHOXO15266 292 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 TNFSF12O43508 249 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RAMP3O60896 148 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 FCGR3BO75015 233 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 CRYZL1O95825 349 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 IGLV2-23P01705 113 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 IGHG2P01859 326 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 HLA-DRB1P01911 266 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 IL7P13232 177 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 PGAM2P15259 253 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 CNTFRP26992 372 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 CD40LGP29965 261 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 PPP5CP53041 499 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 ZNF846Q147U1 533 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 PSG5Q15238 335 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 C5orf64Q2M2E5 130 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 TRIQKQ629K1 86 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 C18orf65Q6ZTR6 163 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 POC5Q8NA72 575 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 OR13C8Q8NGS7 320 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 HARBI1Q96MB7 349 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SCGB3A2Q96PL1 93 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 DUX3Q96PT4 197 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 GPHA2Q96T91 129 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.82□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.81□□□□□ -1.32
CLSTN3-212ENST00000541770 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
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