RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540870.5

SP110-215, Transcript of SP110 nuclear body protein, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SP110, Length 2,032 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP110-215ENST00000540870 FAM90A18PA6NE21 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A16PA6NEW6 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A7PA6NKC0 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A22PA8MWA6 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A12PA8MX19 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 SRRM5B3KS81 715 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 HAND1O96004 215 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 AMBPP02760 352 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TFF1P04155 84 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A15PP0C7V4 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A13PP0C7W8 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A14PP0C7W9 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FAM90A24PP0C7X0 464 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ZBTB25P24278 435 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 COL8A1P27658 744 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CHATP28329 748 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CDKN1AP38936 164 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ELLP55199 621 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 RAB31Q13636 194 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 IL13RA2Q14627 380 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LINC00596Q86U02 117 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TMEM183AQ8IXX5 376 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ISOC2Q96AB3 205 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 HES4Q9HCC6 221 aa7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TANC2Q9HCD6 1990 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PPP5D1E7EU14 171 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 OR2H2O95918 312 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 OR10J4P0C629 311 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CD34P28906 385 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CFHR2P36980 270 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TAS2R19P59542 299 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FBLN7Q53RD9 439 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 SPIN3Q5JUX0 258 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 DTX2Q86UW9 622 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TMEM229BQ8NBD8 167 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 SUMF2Q8NBJ7 301 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 Q8TCH9 128 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 AKR1E2Q96JD6 320 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 HINT2Q9BX68 163 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TMEM106BQ9NUM4 274 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 SLC2A8Q9NY64 477 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 AK3Q9UIJ7 227 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 HSF4Q9ULV5 492 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CENPEQ02224 2701 aa7.12□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CORTO00230 105 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LY6HO94772 140 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LHBP01229 141 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LYNX1P0DP58 116 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LYL1P12980 280 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ATP5IP56385 69 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 DHRS2Q13268 280 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ZNF146Q15072 292 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 Q6P435 159 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TEX38Q6PEX7 206 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 GVQW1Q8N7I0 195 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 GPX8Q8TED1 209 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TMEM186Q96B77 213 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CITED1Q99966 193 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CHST6Q9GZX3 395 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CYTL1Q9NRR1 136 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 OR2C1O95371 312 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 GYPAP02724 150 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 FCGR3AP08637 254 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PSG2P11465 335 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 COL8A2P25067 703 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PRDX2P32119 198 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 ARL3P36405 182 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 COL10A1Q03692 680 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TMEM249Q2WGJ8 235 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 GFI1BQ5VTD9 330 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TMEM268Q5VZI3 342 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 LYPD6BQ8NI32 183 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 CCL19Q99731 98 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 WFDC1Q9HC57 220 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 PARP11Q9NR21 331 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 VAX2Q9UIW0 290 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 COX11Q9Y6N1 276 aa7.11□□□□□ -1.27
SP110-215ENST00000540870 TACC2O95359 2948 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.9 ms