RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537568.1

LMO3-216, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 594 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-216ENST00000537568 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 hDV102S1A0JD36 115 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GJE1A6NN92 205 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 K7N7A8 449 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 M0R036 132 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TP53I11O14683 189 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TRAF3IP2O43734 574 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SOX15O60248 233 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FCGR3BO75015 233 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MPZL1O95297 269 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 IGLV2-14P01704 120 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PRH1P02810 166 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HPNP05981 417 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR8U9P0C7N5 309 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF17P17021 662 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HNF1AP20823 631 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR3A4PP47883 348 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HTR5AP47898 357 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GAGE2BQ13066 116 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PLPPR5Q32ZL2 321 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 AARDQ4LEZ3 155 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SLC22A6Q4U2R8 563 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GAGE2EQ4V326 116 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 COMMD2Q86X83 199 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR8U1Q8NH10 309 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR51F2Q8NH61 342 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF524Q96C55 264 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 C5orf30Q96GV9 206 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM56Q96MV1 263 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 YPEL4Q96NS1 127 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 P2RX4Q99571 388 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NICN1Q9BSH3 213 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PARD6GQ9BYG4 376 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MED29Q9NX70 200 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 GAGE2DQ9UEU5 116 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.58□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RAD51DO75771 328 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZFAND5O76080 213 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NDUFB8O95169 186 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 DIRAS3O95661 229 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR8U8P0C7N1 319 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HLA-DOBP13765 273 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NFYBP25208 207 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CLDN15P56746 228 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PIGPP57054 158 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PROK1P58294 105 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PCBD1P61457 104 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FMODQ06828 376 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF616Q08AN1 781 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HNF4GQ14541 408 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF506Q5JVG8 444 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FAM27BQ5VT28 67 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 LINC00596Q86U02 117 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FBXL14Q8N1E6 418 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 C9orf106Q8NAJ2 232 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 APCDD1LQ8NCL9 501 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NANPQ8TBE9 248 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM54Q969K7 222 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CPNE4Q96A23 557 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM204Q9BSN7 226 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 SFXN3Q9BWM7 321 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 CDH20Q9HBT6 801 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 MIOXQ9UGB7 285 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.57□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HERC1Q15751 4861 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 OR2J2O76002 312 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 KIR2DS4P43632 304 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RBP2P50120 134 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FUT6P51993 359 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FBXW4P57775 412 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 HERV-K104P61576 105 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 DLK1P80370 383 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 H3F3AP84243 136 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 FOXF1Q12946 379 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 IL24Q13007 206 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 KIR2DS1Q14954 304 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 RAB35Q15286 201 aa6.56□□□□□ -1.36
LMO3-216ENST00000537568 TMEM42Q69YG0 159 aa6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89.6 ms