RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000537304.5

LMO3-215, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 1,685 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-215ENST00000537304 NXPH1P58417 271 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 RPL31P62899 125 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 RHOGP84095 191 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CFHR1Q03591 330 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 VAMP3Q15836 100 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TIGITQ495A1 244 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ALKBH2Q6NS38 261 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TMEM136Q6ZRR5 245 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 MUC15Q8N387 334 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SMIM12Q96EX1 92 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 WDR54Q9H977 334 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TMEM167BQ9NRX6 74 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 V9GYV3 84 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 K7ERU9 68 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ISLRO14498 428 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SH2D1BO14796 132 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SYNGR1O43759 233 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CA2P00918 260 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 APCSP02743 223 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 EGR1P18146 543 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 G6PCP35575 357 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 THBS3P49746 956 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 EDDM3BP56851 147 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HLA-BQ31612 363 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 Q6P435 159 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR8I2Q8N0Y5 310 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 LYG1Q8N1E2 194 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 BATF2Q8N1L9 274 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZNF439Q8NDP4 499 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR52E5Q8NH55 327 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 NINJ1Q92982 152 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 VPS25Q9BRG1 176 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CHRDL1Q9BU40 450 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 COMMD5Q9GZQ3 224 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ST20Q9HBF5 79 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IL36RNQ9UBH0 155 aa9.07□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 C15orf62A8K5M9 175 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 WISP2O76076 250 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 PATE4P0C8F1 98 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZNF83P51522 516 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 PLP2Q04941 152 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 Q6ZS52 159 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SYT13Q7L8C5 426 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 Q8N7P7 452 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 NUDT10Q8NFP7 164 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 GALMQ96C23 342 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 RTL8AQ9BWD3 113 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SH2D2AQ9NP31 389 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZNF331Q9NQX6 463 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 C1RLQ9NZP8 487 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IL19Q9UHD0 177 aa9.06□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ADAMTS20P59510 1910 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 LOC105371242A0A075B767 164 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 A0A1W2PRS3 328 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 PGPEP1LA6NFU8 196 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 FNDC10F2Z333 226 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SLC17A3O00476 420 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 NEURL1O76050 574 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 NPY1RP25929 384 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 RNF151Q2KHN1 245 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 C12orf54Q6X4T0 127 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 VASH2Q86V25 355 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 NIT1Q86X76 327 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 TSTD1Q8NFU3 115 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IFI44Q8TCB0 444 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HS3ST6Q96QI5 342 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OR2D2Q9H210 308 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SAP30LQ9HAJ7 183 aa9.05□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 C5orf49A4QMS7 147 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IZUMO1RA6ND01 250 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HELTA6NFD8 242 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 OOEPA6NGQ2 149 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 J3QW42 95 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 K7EN84 100 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 HSBP1O75506 76 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 IGHEP01854 428 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CCL3P10147 92 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 SRIP30626 198 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 REG1BP48304 166 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 CLDN18P56856 261 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 UBE2G1P62253 170 aa9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 KLF5Q13887 457 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
LMO3-215ENST00000537304 PCOLCEQ15113 449 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms