RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534510.5

CTSB-232, Transcript of cathepsin B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTSB, Length 1,989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSB-232ENST00000534510 KCNIP2Q9NS61 270 aa14.63□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 A0A1W2PPV4 95 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 XKRY2A2RUG3 117 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 F6UZH7 168 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 M0R1X1 148 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 DVL1O14640 695 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 MGST3O14880 152 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 YPEL1O60688 119 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TYMSP04818 313 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 EGR1P18146 543 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 NPPCP23582 126 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 OPRK1P41145 380 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PKIAP61925 76 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 ACTL10Q5JWF8 245 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 LINC00469Q8N7U9 141 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 OR2Z1Q8NG97 314 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 RNASEH2CQ8TDP1 164 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 YPEL2Q96QA6 119 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 KNTC1P50748 2209 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 SRRM5B3KS81 715 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PROP1O75360 226 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CD99P14209 185 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 KIR2DS2P43631 304 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 EDDM3BP56851 147 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 SSX9Q7RTT3 188 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 FDCSPQ8NFU4 85 aa14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TMPRSS2O15393 492 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 AMBPP02760 352 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 GNB1P62873 340 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CR1LQ2VPA4 569 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 GCSAMLQ5JQS6 135 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 Q8TCH9 128 aa14.61□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TRAV17A0A0B4J275 112 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TSTD3H0UI37 97 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 NKX2-8O15522 239 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CRYAAP02489 173 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 ATP5G3P48201 142 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 UBE2G2P60604 165 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 P2RY6Q15077 328 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CLEC12BQ2HXU8 276 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CST9LP1Q5W188 147 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 LINC01551Q86U37 167 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TXNDC17Q9BRA2 123 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 DUSP13Q9UII6 198 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PROCRQ9UNN8 238 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 HCFC1P51610 2035 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 F2RL2O00254 374 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PDLIM4P50479 330 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 LCN2P80188 198 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 IGFL2Q6UWQ7 119 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TREML4Q6UXN2 200 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 OR5T1Q8NG75 326 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PLPPR2Q96GM1 343 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 BTF3L4Q96K17 158 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 S1PR3Q99500 378 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 FAM234AQ9H0X4 552 aa14.6□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PRSS46E5RG02 174 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CHRNA7P36544 502 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TMPRSS3P57727 454 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 RELBQ01201 579 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 RPL39P5Q59GN2 51 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 FAM169BQ8N8A8 192 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 IFI27L2Q9H2X8 130 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 FUT9Q9Y231 359 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CACNA1DQ01668 2161 aa14.59□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 RRHO14718 337 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 CFHR2P36980 270 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 NUBP1P53384 320 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 LOXL3P58215 753 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 IMMP2LQ96T52 175 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 MGST2Q99735 147 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 GGTLC1Q9BX51 225 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 MS4A5Q9H3V2 200 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TMEM140Q9NV12 185 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 PXMP4Q9Y6I8 212 aa14.58□□□□□ -0.07
CTSB-232ENST00000534510 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 GFRA3O60609 400 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 NDUFB4O95168 129 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 CXorf1O96002 111 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 FAM78BQ5VT40 261 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 OR4S2Q8NH73 311 aa14.58□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 GPR179Q6PRD1 2367 aa14.57□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa14.57□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 AHRRA9YTQ3 701 aa14.57□□□□□ -0.08
CTSB-232ENST00000534510 TNFSF13O75888 250 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms