RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533051.5

SLC43A3-222, Transcript of solute carrier family 43 member 3, human

TSL 2

Gene SLC43A3, Length 571 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SLC43A3-222	ENST00000533051	PALMD	Q9NP74	551 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	ANAPC10	Q9UM13	185 aa		11.23	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	TSSC4	Q9Y5U2	329 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	NUDT19	A8MXV4	375 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	GABARAP	H6UMI1	98 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	TBP	P20226	339 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	TAS2R19	P59542	299 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	SSBP1	Q04837	148 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	AADACL3	Q5VUY0	350 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF660	Q6AZW8	331 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM65	Q6PI78	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	MFSD4A	Q8N468	514 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	ABHD1	Q96SE0	405 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	HSPB9	Q9BQS6	159 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	KLK11	Q9UBX7	282 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		11.22	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	LINC00473	A8K010	186 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051		M0QYG6	137 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	LYL1	P12980	280 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	ECSCR	Q19T08	205 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM177	Q53S58	311 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	PPP1R27	Q86WC6	154 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	VSTM2A	Q8TAG5	236 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	MOB3A	Q96BX8	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	PHB2	Q99623	299 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	WSB1	Q9Y6I7	421 aa		11.21	□□□□□ -0.61
SLC43A3-222	ENST00000533051	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	LINC01548	A6NM66	108 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	GPR31	O00270	319 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ATP6V0E1	O15342	81 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	RAB3D	O95716	219 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	CA2	P00918	260 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	HRAS	P01112	189 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	PF4	P02776	101 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	CD3D	P04234	171 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	IGF1	P05019	195 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	PGAM2	P15259	253 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	TNFSF8	P32971	234 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	CX3CL1	P78423	397 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	DGCR2	P98153	550 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	DCTN2	Q13561	401 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	MEF2D	Q14814	521 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	SCGB2B2	Q4G0G5	96 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	PYDC2	Q56P42	97 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF562	Q6V9R5	426 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	SPAG16	Q8N0X2	631 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARRDC1	Q8N5I2	433 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	OR51H1	Q8NH63	302 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	GRPEL2	Q8TAA5	225 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	CD300LF	Q8TDQ1	290 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ARPC1A	Q92747	370 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	C5orf30	Q96GV9	206 aa		11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	DISC1	C4P0D8	188 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	CTDSPL	O15194	276 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	MPPED1	O15442	326 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ELANE	P08246	267 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	UBE2K	P61086	200 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ERVK-16	P61578	105 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	CD83	Q01151	205 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	FXYD3	Q14802	87 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	STEAP1B	Q6NZ63	245 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	SLC38A6	Q8IZM9	456 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	TCTEX1D1	Q8N7M0	179 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	TEX45	Q8NA69	505 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	DDB2	Q92466	427 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZFP57	Q9NU63	452 aa		11.19	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	IGLV2-14	P01704	120 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	RLN1	P04808	185 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	GNRHR	P30968	328 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	INPP1	P49441	399 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	RPL30	P62888	115 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	FOXE3	Q13461	319 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	TNXA	Q16473	311 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	C10orf99	Q6UWK7	81 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	GPHA2	Q96T91	129 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	NXF2	Q9GZY0	626 aa	Known RBP	11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	ZNF355P	Q9NSJ1	428 aa		11.18	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051		A0A1W2PN81	502 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	FCN1	O00602	326 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	HPRT1	P00492	218 aa		11.17	□□□□□ -0.62
SLC43A3-222	ENST00000533051	AKAIN1	P0CW23	69 aa		11.17	□□□□□ -0.62

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