RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 LPCAT3Q6P1A2 487 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 TOMM5Q8N4H5 51 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 OR51S1Q8NGJ8 323 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 RASL11BQ9BPW5 248 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 TPSG1Q9NRR2 321 aa14.64□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 DISC1C4P0D8 188 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PI3P19957 117 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 LGALS7P47929 136 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 C9orf152Q5JTZ5 239 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SLC38A6Q8IZM9 456 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 MARCH1Q8TCQ1 289 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa14.63□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 COL7A1Q02388 2944 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SLC25A17O43808 307 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 HLA-DRB1P01911 266 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 IL7P13232 177 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PPP5CP53041 499 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 RND3P61587 244 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 ZNF585BQ52M93 769 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 LIN54Q6MZP7 749 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SPAG16Q8N0X2 631 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 OR51H1Q8NH63 302 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 BORCS5Q969J3 196 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 HARBI1Q96MB7 349 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 GPR132Q9UNW8 380 aa14.62□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SHOXO15266 292 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SPDEFO95238 335 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 RLN1P04808 185 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PF4V1P10720 104 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PGAM2P15259 253 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 IGLL1P15814 213 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CD33P20138 364 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PJVKQ0ZLH3 352 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D26Q86UD7 250 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PRRT1Q99946 306 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 KIAA1456Q9P272 454 aa14.61□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 F2RP25116 425 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 KIR2DS2P43631 304 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 AP3S2P59780 193 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 UBE2KP61086 200 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 NDPQ00604 133 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 C10orf99Q6UWK7 81 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 IDO2Q6ZQW0 420 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 SLC35E3Q7Z769 313 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 OR4S2Q8NH73 311 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CLCC1Q96S66 551 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 C5orf66Q9H5L9 145 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 MCUBQ9NWR8 336 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 LINC00527Q9UJ94 153 aa14.6□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 MPPED1O15442 326 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 PLA2G10O15496 165 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CX3CL1P78423 397 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CATR1Q13166 79 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 CBX3Q13185 183 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 TEX45Q8NA69 505 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 ZFAND1Q8TCF1 268 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 DEDD2Q8WXF8 326 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 S100ZQ8WXG8 99 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 VSIG4Q9Y279 399 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 FBXO7Q9Y3I1 522 aa14.59□□□□□ -0.07
PUF60-218ENST00000531995 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa14.58□□□□□ -0.07
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PUF60-218ENST00000531995 S1PR2O95136 353 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 PF4P02776 101 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 IGF1P05019 195 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 PIGPP57054 158 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 ZNF562Q6V9R5 426 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 PPP1R27Q86WC6 154 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 OR51J1Q9H342 316 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 DNAH9Q9NYC9 4486 aa14.58□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 HPRT1P00492 218 aa14.57□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 CA2P00918 260 aa14.57□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 IGKV1-39P01597 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 IGKV1D-39P04432 117 aa14.57□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 BTCP35070 178 aa14.57□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 FAUP35544 74 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
PUF60-218ENST00000531995 ECI1P42126 302 aa14.57□□□□□ -0.08
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