RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519057.5

COPS5-208, Transcript of COP9 signalosome subunit 5, human

TSL 4

Gene COPS5, Length 566 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
COPS5-208	ENST00000519057	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DCST2	Q5T1A1	773 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	FAM78B	Q5VT40	261 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	NIPAL3	Q6P499	406 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	UNQ5815/PRO19632	Q6UWF5	114 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TEX43	Q6ZNM6	134 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	MBOAT2	Q6ZWT7	520 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF567	Q8N184	647 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	COX18	Q8N8Q8	333 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF709	Q8N972	641 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR5B3	Q8NH48	314 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	C2orf15	Q8WU43	125 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PSMF1	Q92530	271 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DCUN1D4	Q92564	292 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPCDC	Q96CD2	204 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TVP23C	Q96ET8	276 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	BTF3L4	Q96K17	158 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR10C1	Q96KK4	312 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	YPEL4	Q96NS1	127 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OR5B12	Q96R08	314 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	NIPSNAP3B	Q9BS92	247 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CHRDL1	Q9BU40	450 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DERL1	Q9BUN8	251 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LINC00470	Q9BZP3	86 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	APMAP	Q9HDC9	416 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RAB18	Q9NP72	206 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF331	Q9NQX6	463 aa	Predicted RBP	2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SLC17A5	Q9NRA2	495 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DNAJC27	Q9NZQ0	273 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	MRPL27	Q9P0M9	148 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ABRACL	Q9P1F3	81 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SHPK	Q9UHJ6	478 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	MRM2	Q9UI43	246 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF391	Q9UJN7	358 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	JPT1	Q9UK76	154 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SCML2	Q9UQR0	700 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RASD1	Q9Y272	281 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ALPK3	Q96L96	1907 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TRANK1	O15050	2925 aa		2.58	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPIAL4E	A0A075B759	164 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	BORCS7-ASMT	A0A0B4J1R7	106 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPIAL4C	A0A0B4J2A2	164 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SLC22A20	A6NK97	555 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	IFITM5	A6NNB3	132 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPIAL4D	F5H284	164 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		F5H5T6	163 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CLDN34	H7C241	214 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		M0R129	80 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057		M0R1X1	148 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RFXANK	O14593	260 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SH2D1B	O14796	132 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RAB29	O14966	203 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TRAPPC6A	O75865	159 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LRAT	O95237	230 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	BRI3	O95415	125 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GPR75	O95800	540 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TSPAN13	O95857	204 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	IGLV3-25	P01717	112 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CXCL10	P02778	98 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	OPN1SW	P03999	348 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CTSD	P07339	412 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CXCL1	P09341	107 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LINC00032	P0C843	101 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPIAL4F	P0DN26	164 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CTSE	P14091	401 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	HTR1F	P30939	366 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	KDELR2	P33947	212 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ACVR1B	P36896	505 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LPAR6	P43657	344 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PRLHR	P49683	370 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	UCP2	P55851	309 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	H2BFS	P57053	126 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SLC35A1	P78382	337 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	BCL2L1	Q07817	233 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	RAB40B	Q12829	278 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PRDX4	Q13162	271 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	DHRS2	Q13268	280 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	FZD2	Q14332	565 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	MMD	Q15546	238 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	GABRA6	Q16445	453 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	PRSS8	Q16651	343 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	SPATA45	Q537H7	98 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	TCEAL5	Q5H9L2	206 aa		2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	2.57	□□□□□ -2
COPS5-208	ENST00000519057	ZNF678	Q5SXM1	525 aa		2.57	□□□□□ -2

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