RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8N1Y9	231 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF709	Q8N972	641 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WDR31	Q8NA23	367 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SCCPDH	Q8NBX0	429 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	UBALD1	Q8TB05	177 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CT55	Q8WUE5	264 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf52	Q96A22	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	APH1A	Q96BI3	265 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MS4A10	Q96PG2	267 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TAAR6	Q96RI8	345 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM173A	Q9BQD7	235 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DERL1	Q9BUN8	251 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SPRY4	Q9C004	299 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CBLN4	Q9NTU7	201 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LAMA1	P25391	3075 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SDK1	Q7Z5N4	2213 aa		4.13	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A0U1RQK1	487 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF320	A2RRD8	509 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C17orf112	F2Z3M2	114 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		M0QZK8	103 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	RRH	O14718	337 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D1B	O14796	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZG16	O60844	167 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MPDU1	O75352	247 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFSF13	O75888	250 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NDUFB4	O95168	129 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HAND1	O96004	215 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	HPRT1	P00492	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PDGFB	P01127	241 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CRYAB	P02511	175 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DEFA4	P12838	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	EGR1	P18146	543 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TIMP3	P35625	211 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OPRK1	P41145	380 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR3A1	P47881	315 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LGALS4	P56470	323 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	PAFAH1B2	P68402	229 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GAGE1	Q13065	139 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	USF2	Q15853	346 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SPINK14	Q6IE38	97 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TIPARP	Q7Z3E1	657 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF808	Q8N4W9	903 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8N976	141 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10P1	Q8NGE3	313 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR52E5	Q8NH55	327 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		Q8TCH9	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NINJ1	Q92982	152 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	COQ2	Q96H96	371 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	GMPPA	Q96IJ6	420 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ATG101	Q9BSB4	218 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LSM4	Q9Y4Z0	139 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAPPC1	Q9Y5R8	145 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LY96	Q9Y6Y9	160 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		4.12	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NCKAP5	O14513	1909 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TRAV38-1	A0A0B4J264	116 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MARCH11	A6NNE9	402 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	LINC00473	A8K010	186 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	IQCF6	A8MYZ5	107 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		C9JCJ5	164 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746		K7EN84	100 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CDIPT	O14735	213 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SMPD2	O60906	423 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	MMP23A	O75900	390 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	NXPH2	O95156	264 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	SP1	P08047	785 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR10J4	P0C629	311 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	OR9G9	P0C7N8	305 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL14EPL	P0DKL9	152 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	AREG	P15514	252 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CD1B	P29016	333 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	COMP	P49747	757 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	TNFSF10	P50591	281 aa		4.11	□□□□□ -1.75
ATXN3-212	ENST00000515746	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75

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