RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515479.5

RUFY3-215, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 2

Gene RUFY3, Length 893 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-215ENST00000515479 PRKXP51817 358 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 UBA52P62987 128 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DLK1P80370 383 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 COTL1Q14019 142 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SMCO1Q147U7 214 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF146Q15072 292 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR1C1Q15619 314 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RSPO1Q2MKA7 263 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 FAM27BQ5VT28 67 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CARD17Q5XLA6 110 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM42Q69YG0 159 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR52W1Q6IF63 320 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C12orf54Q6X4T0 127 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SLC16A13Q7RTY0 426 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ANGPTL5Q86XS5 388 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 KCNRGQ8N5I3 272 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 GVQW1Q8N7I0 195 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF283Q8N7M2 679 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C15orf54Q8N8G6 183 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PXT1Q8NFP0 134 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 BPIFCQ8NFQ6 507 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR56B1Q8NGI3 324 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR6K3Q8NGY3 331 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR8S1Q8NH09 359 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 AKR7LQ8NHP1 331 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 KCNG3Q8TAE7 436 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 STOML3Q8TAV4 291 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PP6455Q8WZ26 134 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM45BQ96B21 275 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SPSB1Q96BD6 273 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MOB3AQ96BX8 217 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MALSU1Q96EH3 234 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PHYHIPLQ96FC7 376 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF799Q96GE5 643 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 C14orf144Q96I85 54 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CXorf58Q96LI9 332 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SPACA5Q96QH8 159 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CCL19Q99731 98 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SSX3Q99909 188 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ULBP2Q9BZM5 246 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 FXYD6Q9H0Q3 95 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CST11Q9H112 138 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TNFRSF19Q9NS68 423 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DEPPQ9NTK1 212 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM38BQ9NVV0 291 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RASL12Q9NYN1 266 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 GHRLQ9UBU3 117 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SHPKQ9UHJ6 478 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RNF150Q9ULK6 438 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 KLF13Q9Y2Y9 288 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MRPS18CQ9Y3D5 142 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 A0A0D9SG52 128 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 A0A1B0GV90 55 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PINLYPA6NC86 204 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TMEM210A6NLX4 147 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ZNF726A6NNF4 738 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SERPINE3A8MV23 424 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 NPIPA2E9PIF3 369 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 NPIPA3F8WFD2 350 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 G3V3Y1 287 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CCSO14618 274 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TNFSF11O14788 317 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SOCS1O15524 211 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CYTIPO60759 359 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CBR3O75828 277 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR2F2O95006 317 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MT-ND4LP03901 98 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OPN1LWP04000 364 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CRHP06850 196 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HCKP08631 526 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 LINC00614P0C842 121 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MGMTP16455 207 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CNR1P21554 472 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CPT2P23786 658 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 ACKR3P25106 362 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 MAS1LP35410 378 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CYB561P49447 251 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 CLDN15P56746 228 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 TAS2R46P59540 309 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 RAB2AP61019 212 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 PKIAP61925 76 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 DEFA5Q01523 94 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 OR2F1Q13607 317 aa3.28□□□□□ -1.88
RUFY3-215ENST00000515479 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms