RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513325.5

HERC3-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-211ENST00000513325 ACTL6BO94805 426 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 MECP2P51608 486 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ATP5G2Q06055 141 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 CDK10Q15131 360 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 CDNFQ49AH0 187 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 C10orf55Q5SWW7 151 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 FAM223AQ8IWN6 122 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 SPIN2AQ99865 258 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 PEMTQ9UBM1 199 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 SACSQ9NZJ4 4579 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 DNAH7Q8WXX0 4024 aa12.84□□□□□ -0.35
HERC3-211ENST00000513325 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DTYMKP23919 212 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 ARL6IP1Q15041 203 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 C22orf42Q6IC83 251 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 IZUMO2Q6UXV1 221 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 MMD2Q8IY49 270 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF645Q8N7E2 425 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 BLOC1S6Q9UL45 172 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR2W1Q9Y3N9 320 aa12.83□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TNCP24821 2201 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TUSC2O75896 110 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 RPL30P62888 115 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR2B11Q5JQS5 317 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 KCTD9Q7L273 389 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TTC9CQ8N5M4 171 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 VCX3BQ9H321 246 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 RYR2Q92736 4967 aa12.82□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 AIREO43918 545 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR2J3O76001 311 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 IGLV2-14P01704 120 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HLA-DQB1P01920 261 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 IFNA6P05013 189 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CTXN2P0C2S0 81 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CD36P16671 472 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CD81P60033 236 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HACD4Q5VWC8 232 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 NECAP1Q8NC96 275 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR2K2Q8NGT1 345 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 PLEKHA3Q9HB20 300 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa12.81□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TMEM235A6NFC5 223 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HMX3A6NHT5 357 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 PPP5D1E7EU14 171 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 IGKV1-13P0DP09 117 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 GALP22466 123 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HSPA13P48723 471 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 C15orf32Q32M92 178 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR51E2Q9H255 320 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DCSTAMPQ9H295 470 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 RETNQ9HD89 108 aa12.8□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF785A8K8V0 405 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 NOTOA8MTQ0 251 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC22A5O76082 557 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CNIH2Q6PI25 160 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 C19orf35Q6ZS72 473 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DYNLRB2Q8TF09 96 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 NEURL2Q9BR09 285 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 SPATA2Q9UM82 520 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DMRT1Q9Y5R6 373 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CEPT1Q9Y6K0 416 aa12.79□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TEX22C9J3V5 150 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 E7EUB6 86 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 SSX5O60225 188 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TPPPO94811 219 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR2C1O95371 312 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 CD7P09564 240 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 EDN2P20800 178 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 BRWD1-AS2P59051 145 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 GNG2P59768 71 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 DEFB114Q30KQ6 69 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC25A42Q86VD7 318 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 LAX1Q8IWV1 398 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR4S2Q8NH73 311 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 OR2A7Q96R45 310 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 HIPK2Q9H2X6 1198 aa12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP12.78□□□□□ -0.36
HERC3-211ENST00000513325 SLC2A8Q9NY64 477 aa12.78□□□□□ -0.36
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