RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509355.5

PDE4D-217, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 847 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-217ENST00000509355 HILPDAQ9Y5L2 63 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP3.22□□□□□ -1.89
PDE4D-217ENST00000509355 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RPL37AP8A6NKH3 93 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C12orf77C9JDV5 145 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 LRRN3E7EW58 273 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 HMGN4O00479 90 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 SGCEO43556 437 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 DENRO43583 198 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 BGLAPP02818 100 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 OR8U8P0C7N1 319 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RBMY1CP0DJD4 496 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 CT45A10P0DMU9 189 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 COX5BP10606 129 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 PRPS1L1P21108 318 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 UGT2B15P54855 530 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 RPL32P62910 135 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 ACTC1P68032 377 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ACTA1P68133 377 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 Q1RN00 199 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C10orf128Q5T292 105 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF691Q5VV52 312 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 TEX36Q5VZQ5 186 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ACP7Q6ZNF0 438 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ZNF826PQ6ZT77 177 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 LHFPL3Q86UP9 236 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C10orf107Q8IVU9 208 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 DYNAPQ8N1N2 210 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 LRRC29Q8WV35 223 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 BAALCQ8WXS3 180 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 FCRL1Q96LA6 429 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 ZNF391Q9UJN7 358 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ANGPT4Q9Y264 503 aa3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 SNX24Q9Y343 169 aa3.21□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 H3BN98 237 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 M0QZK8 103 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 ITGB1BP1O14713 200 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 OVOL1O14753 267 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 BCHEP06276 602 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 CD24P25063 80 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 HIST3H3Q16695 136 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 ATAD3CQ5T2N8 411 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 DRAM1Q8N682 238 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 OR8S1Q8NH09 359 aa3.2□□□□□ -1.9
PDE4D-217ENST00000509355 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.2□□□□□ -1.9
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PDE4D-217ENST00000509355 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP3.2□□□□□ -1.9
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