RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 CADM3Q8N126 398 aa11.5□□□□□ -0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 PLEKHA2Q9HB19 425 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC2A8Q9NY64 477 aa11.5□□□□□ -0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 COMMD9Q9P000 198 aa11.5□□□□□ -0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A42Q86VD7 318 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4C16Q8NGL9 310 aa11.47□□□□□ -0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.47□□□□□ -0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 ATP6V0E1O15342 81 aa11.46□□□□□ -0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 POU2AF1Q16633 256 aa11.46□□□□□ -0.57
SH3BP2-208ENST00000504294 PRSS8Q16651 343 aa11.46□□□□□ -0.57
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SH3BP2-208ENST00000504294 KBTBD11O94819 623 aa11.45□□□□□ -0.58
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SH3BP2-208ENST00000504294 GNB1P62873 340 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF79Q15937 498 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR31Q5SQ13 230 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.45□□□□□ -0.58
SH3BP2-208ENST00000504294 TRIM63Q969Q1 353 aa11.45□□□□□ -0.58
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