RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498638.1

C7orf43-210, Transcript of chromosome 7 open reading frame 43, humanhuman

TSL 3

Gene C7orf43, Length 626 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C7orf43-210ENST00000498638 HES4Q9HCC6 221 aa6.63□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 PILRBQ9UKJ0 227 aa6.63□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.63□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 DOCK9Q9BZ29 2069 aa6.62□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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C7orf43-210ENST00000498638 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
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C7orf43-210ENST00000498638 ARID1AO14497 2285 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa6.6□□□□□ -1.35
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C7orf43-210ENST00000498638 OR2J3O76001 311 aa6.6□□□□□ -1.35
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C7orf43-210ENST00000498638 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 HLA-BQ31612 363 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 RNFT1Q5M7Z0 435 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 Q6P435 159 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 FAM231DQ6ZW35 169 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 ABCA7Q8IZY2 2146 aa6.6□□□□□ -1.35
C7orf43-210ENST00000498638 BATF2Q8N1L9 274 aa6.6□□□□□ -1.35
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