RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 RGS10O43665 173 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 GNB3P16520 340 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DUTP33316 252 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CD81P60033 236 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 EXOSC2Q13868 293 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 IDO2Q6ZQW0 420 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SLC25A42Q86VD7 318 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 NECAP1Q8NC96 275 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DYNLRB2Q8TF09 96 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 NEURL2Q9BR09 285 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 HIPK2Q9H2X6 1198 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DUSP21Q9H596 190 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PLEKHA3Q9HB20 300 aa9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 BMPR1BO00238 502 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PRH1P02810 166 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FABP5Q01469 135 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ARL6IP1Q15041 203 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CDK10Q15131 360 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00322Q6ZN03 302 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MMD2Q8IY49 270 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TTC9CQ8N5M4 171 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MAFIPQ8WZ33 124 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DDB2Q92466 427 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MGLLQ99685 303 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa9.11□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00473A8K010 186 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF785A8K8V0 405 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 OR11H12B2RN74 326 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 GGCTO75223 188 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SLC22A5O76082 557 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 CTXN2P0C2S0 81 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RAB6AP20340 208 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PLA2G7Q13093 441 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 GUCA2BQ16661 112 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB114Q30KQ6 69 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZS49 121 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 C5orf30Q96GV9 206 aa9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TECRQ9NZ01 308 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DPPA5A6NC42 116 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 IFITM5A6NNB3 132 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 J3QRK9 145 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RAB27BO00194 218 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 MFNGO00587 321 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FCGR3BO75015 233 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 OR2J3O76001 311 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FOLR2P14207 255 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 KIR2DS2P43631 304 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF45Q02386 682 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 SSX1Q16384 188 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 C15orf32Q32M92 178 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 PRSS48Q7RTY5 328 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 DEFB125Q8N687 156 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 FAM110AQ9BQ89 295 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 OR51E2Q9H255 320 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 RETNQ9HD89 108 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa9.09□□□□□ -0.95
CNOT4-211ENST00000498534 STARD9Q9P2P6 4700 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 C2orf70A6NJV1 201 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 OR2C1O95371 312 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 DHFRP00374 187 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 CD7P09564 240 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 CD36P16671 472 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 DTYMKP23919 212 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 MYL9P24844 172 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 MAP2K4P45985 399 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 OR10A3P58181 314 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 CDNFQ49AH0 187 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 FAM106AQ4KMX7 169 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 KCTD9Q7L273 389 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 SLC16A13Q7RTY0 426 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF645Q8N7E2 425 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 VSTM2AQ8TAG5 236 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 SRD5A3Q9H8P0 318 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 FBXL7Q9UJT9 491 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 OR2W1Q9Y3N9 320 aa9.08□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF320A2RRD8 509 aa9.07□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 PPP5D1E7EU14 171 aa9.07□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 LGALS9O00182 355 aa9.07□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 HLA-DQB1P01920 261 aa9.07□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 RAB3BP20337 219 aa9.07□□□□□ -0.96
CNOT4-211ENST00000498534 CBLN1P23435 193 aa9.07□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms