RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493715.1

CHTF18-212, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 3

Gene CHTF18, Length 691 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-212ENST00000493715 SLC35D1Q9NTN3 355 aa10.61□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP10.61□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 SPDEFO95238 335 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 DIRAS3O95661 229 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 APOA2P02652 100 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 CBX5P45973 191 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 SNX29P2Q8IUI4 249 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 GPX8Q8TED1 209 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 ABHD5Q8WTS1 349 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 CITED4Q96RK1 184 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 ABHD1Q96SE0 405 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 ANAPC10Q9UM13 185 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 VSIG4Q9Y279 399 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 DNAH1Q9P2D7 4330 aa10.6□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 SULT1C2O00338 296 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 CTDSPLO15194 276 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 SLC25A17O43808 307 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 IGLV2-23P01705 113 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 ETV6P41212 452 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 RUNX1Q01196 453 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 IL18Q14116 193 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 PYHIN1Q6K0P9 492 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 LINC00299Q6ZSB3 139 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 PPP1R27Q86WC6 154 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 GINS4Q9BRT9 223 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 V9GYH0 126 aa10.59□□□□□ -0.71
CHTF18-212ENST00000493715 FABP12A6NFH5 140 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF616Q08AN1 781 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF562Q6V9R5 426 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 HOGA1Q86XE5 327 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 GVQW1Q8N7I0 195 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 BVESQ8NE79 360 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 LFNGQ8NES3 379 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 OR1N2Q8NGR9 330 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 HARBI1Q96MB7 349 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP10.58□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 GABARAPH6UMI1 98 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 J3QRK9 145 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 CRYGBP07316 175 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 OR8U8P0C7N1 319 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 NAT1P18440 290 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 INSL3P51460 131 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 PJVKQ0ZLH3 352 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ACTBL2Q562R1 376 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SPANXN2Q5MJ10 180 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 OVCH2Q7RTZ1 564 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 BEST4Q8NFU0 473 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 OR52I2Q8NH67 350 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 GRPEL2Q8TAA5 225 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SMIM4Q8WVI0 70 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 DDB2Q92466 427 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ARPC1AQ92747 370 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 IFT46Q9NQC8 304 aa10.57□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 MEIS3P1A6NDR6 274 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 LINC00473A8K010 186 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 JTBO76095 146 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 IGHV3-11P01762 117 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 DUTP33316 252 aaKnown RBP10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 RCVRNP35243 200 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 FXYD3Q14802 87 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 AKIRIN2Q53H80 203 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 TMEM177Q53S58 311 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SNAPC3Q92966 411 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 MS4A10Q96PG2 267 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 MTFP1Q9UDX5 166 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ANXA10Q9UJ72 324 aa10.56□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 A0A087WW49 117 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SHOXO15266 292 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 CTXN2P0C2S0 81 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 LGALS7P47929 136 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SLURP1P55000 103 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 TPPP2P59282 170 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 ZNF79Q15937 498 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 MFSD4AQ8N468 514 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 FCAMRQ8WWV6 532 aa10.55□□□□□ -0.72
CHTF18-212ENST00000493715 DCUN1D4Q92564 292 aa10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms