RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491266.5

RABGGTB-212, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, human

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 961 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RABGGTB-212	ENST00000491266	MZT2B	Q6NZ67	158 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	BTNL3	Q6UXE8	466 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMED4	Q7Z7H5	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF383	Q8NA42	475 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ENKUR	Q8TC29	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DDB2	Q92466	427 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TP53RK	Q96S44	253 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PRRT1	Q99946	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SMR3A	Q99954	134 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC5A7	Q9GZV3	580 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR2D2	Q9H210	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MGAT4A	Q9UM21	535 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAA2-SAA4	A0A096LPE2	208 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPVL3	A0A0U1RRI6	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAGE10	A6NGK3	116 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FOXH1	O75593	365 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RBP4	P02753	201 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RLN1	P04808	185 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IFNA6	P05013	189 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IL5	P05113	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR4E1	P0C645	316 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SAA2	P0DJI9	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PGAM2	P15259	253 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CXCL3	P19876	107 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	REG1B	P48304	166 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	LUM	P51884	338 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF137P	P52743	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAG2	P55895	527 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIGP	P57054	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RND3	P61587	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TMEM187	Q14656	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FCN2	Q15485	313 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TATDN3	Q17R31	274 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	IZUMO4	Q1ZYL8	232 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRGPRG-AS1	Q2M3A8	158 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q3ZCU0	254 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MIDN	Q504T8	468 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF626	Q68DY1	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PLET1	Q6UQ28	207 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLDN	Q6ZMI3	551 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GLYATL2	Q8WU03	294 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAB39B	Q96DA2	213 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PCGF1	Q9BSM1	259 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MRPL20	Q9BYC9	149 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAL3ST2	Q9H3Q3	398 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SLC2A9	Q9NRM0	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	PIPOX	Q9P0Z9	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SCP2D1	Q9UJQ7	156 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GAB2	Q9UQC2	676 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ZNF469	Q96JG9	3925 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CR1	P17927	2039 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A0A0MQY5	61 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		A0A1W2PPI3	338 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SRRM4	A7MD48	611 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	CENPX	A8MT69	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	MPTX1	A8MV57	137 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		B4DSR2	109 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		G3V3Q6	166 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	BUB1B-PAK6	H3BSN5	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	GPR31	O00270	319 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	HSPA12A	O43301	675 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	RAMP3	O60896	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SIX6	O95475	246 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	SFT2D2	O95562	160 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	OR5AC1	P0C628	307 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		P0C879	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	AKR1C4	P17516	323 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	DHRS2	Q13268	280 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266		Q5BKY6	102 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RABGGTB-212	ENST00000491266	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		4.91	□□□□□ -1.62

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