RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 GDPD1Q8N9F7 314 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF565Q8N9K5 539 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 LY6G5BQ8NDX9 201 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR8H1Q8NGG4 311 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR56B4Q8NH76 319 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OCC1Q8TAD7 63 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 RAB39BQ96DA2 213 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 FAHD2AQ96GK7 314 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF714Q96N38 554 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SMR3AQ99954 134 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SUCNR1Q9BXA5 334 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 SLA2Q9H6Q3 261 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF286AQ9HBT8 521 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SIRT7Q9NRC8 400 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 CALYQ9NYX4 217 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 EHFQ9NZC4 300 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.8□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 SULT1C2O00338 296 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 RLN1P04808 185 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 ZNF735P0CB33 412 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 IGHV4-31P0DP07 118 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 STEAP1BQ6NZ63 245 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 OR5H2Q8NGV7 314 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf40Q8WUR7 153 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 GALMQ96C23 342 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 ABHD14BQ96IU4 210 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 GINS4Q9BRT9 223 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 LINC00312Q9Y6C7 94 aa3.79□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa3.78□□□□□ -1.8
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PTPRC-211ENST00000484135 A0A1W2PRV1 198 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 OR5H14A6NHG9 310 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRC-211ENST00000484135 C15orf62A8K5M9 175 aa3.78□□□□□ -1.8
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