RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476336.5

PRAME-211, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 2

Gene PRAME, Length 589 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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PRAME-211ENST00000476336 ISOC1Q96CN7 298 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 USMG5Q96IX5 58 aa10.38□□□□□ -0.75
PRAME-211ENST00000476336 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP10.38□□□□□ -0.75
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PRAME-211ENST00000476336 BET1LQ9NYM9 111 aa10.38□□□□□ -0.75
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