RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474188.1

NISCH-206, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-206ENST00000474188 RYR1P21817 5038 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 M0R1X1 148 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 CTDSP2O14595 271 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 SPDEFO95238 335 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 ZP3P21754 424 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 IGSF11Q5DX21 431 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 C10orf55Q5SWW7 151 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 PDPNQ86YL7 162 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 BVESQ8NE79 360 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 DDB2Q92466 427 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 PECRQ9BY49 303 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 MIXL1Q9H2W2 232 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 SLC35D1Q9NTN3 355 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 A0A1B0GW64 132 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 E7EUB6 86 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 H3BUA1 57 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 UCHL1P09936 223 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 GSTT2P0CG29 244 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 GSTT2BP0CG30 244 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 UBBP0CG47 229 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 SRMP19623 302 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 ZBTB25P24278 435 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 TNFSF8P32971 234 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 TMEM177Q53S58 311 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 IDO2Q6ZQW0 420 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 MS4A15Q8N5U1 240 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 MAFIPQ8WZ33 124 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 SOSTQ9BQB4 213 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 MSGN1A6NI15 193 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 LINC00473A8K010 186 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 H0Y980 276 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 BPNT1O95861 308 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 S100A5P33763 92 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 OXA1LQ15070 435 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 GLT8D1Q68CQ7 371 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 MOB1BQ7L9L4 216 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 CEACAM19Q7Z692 300 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 CACNG8Q8WXS5 425 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 PHYHIPQ92561 330 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 HSF4Q9ULV5 492 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 V9GYH0 126 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-206ENST00000474188 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TRDCB7Z8K6 153 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 PPP5D1E7EU14 171 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SLC17A2O00624 439 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 UPK1BO75841 260 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CNIH1O95406 144 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RHOGP84095 191 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 PRSS8Q16651 343 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 HSD17B12Q53GQ0 312 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TPRA1Q86W33 373 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 Q8N402 240 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR6M1Q8NGM8 313 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 NEURL2Q9BR09 285 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CABLES2Q9BTV7 478 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 OR2D2Q9H210 308 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TUBA4BQ9H853 241 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 A0A0G2JLM5 398 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 FABP7O15540 132 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 IGLV2-14P01704 120 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MYOD1P15172 320 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CD81P60033 236 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 MXD1Q05195 221 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 ZNF79Q15937 498 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 C2orf76Q3KRA6 126 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 LYSMD2Q8IV50 215 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 LAX1Q8IWV1 398 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 CENPSQ8N2Z9 138 aa8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
NISCH-206ENST00000474188 AP3S1Q92572 193 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms