RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 A0A1B0GW64 132 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SMIM30A4D0T7 59 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 E7EUB6 86 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RAB27BO00194 218 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DUTP33316 252 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RPL30P62888 115 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 PMS2P11Q13670 270 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 C15orf32Q32M92 178 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 VMA21Q3ZAQ7 101 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RNLSQ5VYX0 342 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 GINS4Q9BRT9 223 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 PEMTQ9UBM1 199 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RBM14-RBM4A0A0A0MSL8 147 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TEX22C9J3V5 150 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ANKRD65E5RJM6 399 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MFNGO00587 321 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FCGR3BO75015 233 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 NDUFB8O95169 186 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 AREGP15514 252 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SERPINB10P48595 397 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CBX3Q13185 183 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TEX45Q8NA69 505 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TMEM68Q96MH6 324 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 SLC2A8Q9NY64 477 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 V9GY05 133 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1D-13A0A0B4J2D9 117 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FAM223BA6NKX1 122 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 EBAG9O00559 213 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TUSC2O75896 110 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 REG1AP05451 166 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 IGKV1-13P0DP09 117 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 KIR2DS2P43631 304 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TPBGQ13641 420 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CLEC19AQ6UXS0 136 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FAM223AQ8IWN6 122 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 TTC9CQ8N5M4 171 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CCDC140Q96MF4 163 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 OVOL2Q9BRP0 275 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 CCDC90BQ9GZT6 254 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 MLXQ9UH92 298 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 FBXL7Q9UJT9 491 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 RAB22AQ9UL26 194 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-209ENST00000473257 ZNF320A2RRD8 509 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 AIREO43918 545 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ACTL6BO94805 426 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 LY6G6CO95867 125 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ARFRP1Q13795 201 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CDK10Q15131 360 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TM4SF20Q53R12 229 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 NECAP1Q8NC96 275 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 OR2K2Q8NGT1 345 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 FANCD2OSQ96PS1 177 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 C8orf4Q9NR00 106 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TMEM213A2RRL7 107 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CXorf65A6NEN9 183 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 GGCTO75223 188 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ARL6IP5O75915 188 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 IGLV2-14P01704 120 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RRASP10301 218 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 PTHLHP12272 177 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 CBLN1P23435 193 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ARL3P36405 182 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 TALDO1P37837 337 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 AQP4P55087 323 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 BRWD1-AS2P59051 145 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SSX1Q16384 188 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 BTNL8Q6UX41 500 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 KCTD9Q7L273 389 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SSX9Q7RTT3 188 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 UXS1Q8NBZ7 420 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 IL17DQ8TAD2 202 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SPIN2AQ99865 258 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SPIN2BQ9BPZ2 258 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SCN3BQ9NY72 215 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 SPATA2Q9UM82 520 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 A0A0J9YWU9 116 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 MFSD2BA6NFX1 497 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 RGS10O43665 173 aa8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
ACTB-209ENST00000473257 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms