RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC38A6Q8IZM9 456 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MFSD4AQ8N468 514 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 DEDD2Q8WXF8 326 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARPC1AQ92747 370 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PARP11Q9NR21 331 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 NOTCH1P46531 2555 aa6.5□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRAV41A0A0B4J266 112 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 M0QYG6 137 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FCN1O00602 326 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ARPC1BO15143 372 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
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TRAPPC3-206ENST00000469757 KBTBD11O94819 623 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF735P0CB33 412 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TAS2R31P59538 309 aa6.49□□□□□ -1.37
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TRAPPC3-206ENST00000469757 PLGLAQ15195 96 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
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TRAPPC3-206ENST00000469757 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 STEAP1BQ6NZ63 245 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 LPCAT3Q6P1A2 487 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF329Q86UD4 541 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 VSTM2AQ8TAG5 236 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MRGPRFQ96AM1 343 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPHA2Q96T91 129 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC2A9Q9NRM0 540 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZFP57Q9NU63 452 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa6.49□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 G3V318 75 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 H3BUA1 57 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 J3QRK9 145 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TNFSF12O43508 249 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SOX15O60248 233 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RAB3DO95716 219 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 HRASP01112 189 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RLN1P04808 185 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 F2RP25116 425 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 S100A5P33763 92 aa6.48□□□□□ -1.37
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TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2B11Q5JQS5 317 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ETV3LQ6ZN32 361 aa6.48□□□□□ -1.37
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4F17Q8NGA8 305 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4C16Q8NGL9 310 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR51H1Q8NH63 302 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4A5Q8NH83 315 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 C4orf3Q8WVX3 66 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RHOVQ96L33 236 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMEM68Q96MH6 324 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR4F4Q96R69 305 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 AIFM2Q9BRQ8 373 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 BET1LQ9NYM9 111 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 LINC00527Q9UJ94 153 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.47□□□□□ -1.37
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TRAPPC3-206ENST00000469757 H0Y980 276 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR2A4O95047 310 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 S1PR2O95136 353 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 HPRT1P00492 218 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 IFNA6P05013 189 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 AKAIN1P0CW23 69 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 NQO2P16083 231 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 MAS1LP35410 378 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 FXYD3Q14802 87 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 KLK9Q2XQG4 91 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF585BQ52M93 769 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.47□□□□□ -1.37
TRAPPC3-206ENST00000469757 ASPHD1Q5U4P2 390 aa6.47□□□□□ -1.37
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