RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469717.5

TPM3-215, Transcript of tropomyosin 3, humanhuman

TSL 2

Gene TPM3, Length 4,041 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM3-215ENST00000469717 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SELENOTP62341 195 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 LCN2P80188 198 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 OR8B8Q15620 311 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 Q6ZSR3 168 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A45Q8N413 288 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 OCC1Q8TAD7 63 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 LRFN3Q9BTN0 628 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 GNB4Q9HAV0 340 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 DEPPQ9NTK1 212 aa6.7□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 DLL1O00548 723 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 FCN1O00602 326 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ZG16O60844 167 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 FUT6P51993 359 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 EDDM3BP56851 147 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 C10orf128Q5T292 105 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TMEM108Q6UXF1 575 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 STARD4Q96DR4 205 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SRXN1Q9BYN0 137 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 C12orf49Q9H741 205 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 LOXL2Q9Y4K0 774 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 C22orf46C9J442 243 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 G6PCP35575 357 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 CTRLP40313 264 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ZNF90Q03938 601 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TMEM54Q969K7 222 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 OR2W1Q9Y3N9 320 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SNURFLB1AK76 121 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SERPINA7P05543 415 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 KITLGP21583 273 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 AMTP48728 403 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 HNRNPA3P51991 378 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 NHLH1Q02575 133 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ABHD17BQ5VST6 288 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 VASH2Q86V25 355 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 CLDN23Q96B33 292 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 OCIAD1Q9NX40 245 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ABI3Q9P2A4 366 aa6.69□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 K7EN84 100 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 IGLC2P0DOY2 106 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 IGLC3P0DOY3 106 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TCL1AP56279 114 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 FAM27BQ5VT28 67 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 PMS2CLQ68D20 193 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 C10orf35Q96D05 121 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 A0A0J9YW62 118 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 F6UZH7 168 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 RRHO14718 337 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 PPBPP02775 128 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SLC25A53Q5H9E4 307 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 FGFRL1Q8N441 504 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TECTBQ96PL2 329 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 UHRF2Q96PU4 802 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 CSTL1Q9H114 145 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 PCED1AQ9H1Q7 454 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 NRN1Q9NPD7 142 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 IL36GQ9NZH8 169 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 CTXN2P0C2S0 81 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SP9P0CG40 484 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 NTF3P20783 257 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 C1orf174Q8IYL3 243 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ZNF808Q8N4W9 903 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SIGLECL1Q8N7X8 197 aa6.68□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 VENTXO95231 258 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 GFRA1P56159 465 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 FOXL1Q12952 345 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 HES3Q5TGS1 186 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 S100A7AQ86SG5 101 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ARFGEF3Q5TH69 2177 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 LILRA5A6NI73 299 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 KLK10O43240 276 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 VAMP5O95183 116 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 GPX1P07203 203 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 TIMP3P35625 211 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 YPEL3P61236 119 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 ARG2P78540 354 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 PRDX4Q13162 271 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 CEACAM16Q2WEN9 425 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 OR8I2Q8N0Y5 310 aa6.67□□□□□ -1.34
TPM3-215ENST00000469717 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
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