RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463369.5

SHQ1-203, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SHQ1, Length 2,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SHQ1-203ENST00000463369 TMEM89A2RUT3 159 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-203ENST00000463369 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-203ENST00000463369 OR2J2O76002 312 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-203ENST00000463369 VENTXO95231 258 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-203ENST00000463369 IGLV3-1P01715 115 aa7.34□□□□□ -1.23
SHQ1-203ENST00000463369 GYPAP02724 150 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-203ENST00000463369 TMEM144Q7Z5S9 345 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-203ENST00000463369 VKORC1Q9BQB6 163 aa7.34□□□□□ -1.23
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SHQ1-203ENST00000463369 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 C20orf196Q8IYI0 205 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 ZNF525Q8N782 197 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 OR5AU1Q8NGC0 362 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 RNF138Q8WVD3 245 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa7.32□□□□□ -1.24
SHQ1-203ENST00000463369 COX11Q9Y6N1 276 aa7.32□□□□□ -1.24
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