RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SEC11CQ9BY50 192 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 EGLN1Q9GZT9 426 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SAP30LQ9HAJ7 183 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RAB9BQ9NP90 201 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 UQCC1Q9NVA1 299 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 GNG12Q9UBI6 72 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FAM96BQ9Y3D0 163 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 PPIAL4AQ9Y536 164 aa4.62□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 TIMM9Q9Y5J7 89 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SESN1Q9Y6P5 492 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 NAV3Q8IVL0 2385 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TRAV3A0A0B4J244 114 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1W2PPR1 153 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 NKX6-3A6NJ46 265 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FAM90A27PA6NNH2 459 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 H3BP45 60 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 M0R1X1 148 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 WRBO00258 174 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DFFBO76075 338 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 NXPH3O95157 252 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LY86O95711 162 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 METTL15P1P0C7V9 234 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CT45A6P0DMU7 189 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CT45A5P0DMU8 189 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CT45A7P0DMV0 189 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IAPPP10997 89 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 NQO2P16083 231 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IGFBP2P18065 325 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 THBS3P49746 956 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 GNB2P62879 340 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 CCL20P78556 96 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RUNX1Q01196 453 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF726P1Q15940 193 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 BSXQ3C1V8 233 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR2B11Q5JQS5 317 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FAM71F2Q6NXP2 309 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DTX2Q86UW9 622 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 STX12Q86Y82 276 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 THNSL2Q86YJ6 484 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 C1orf87Q8N0U7 546 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DEFB108BQ8NET1 73 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR5AN1Q8NGI8 311 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf46Q8TAG6 207 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 MBD3L1Q8WWY6 194 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ADTRPQ96IZ2 230 aa4.61□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 HRH4Q9H3N8 390 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM14BQ9NUH8 114 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 PSENENQ9NZ42 101 aa4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MYO18BQ8IUG5 2567 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ABCA2Q9BZC7 2435 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 C15orf61A6NNL5 157 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 VSTM5A8MXK1 200 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DVL1O14640 695 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS2O15393 492 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 NDUFA2O43678 99 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FCGR3BO75015 233 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1D-33P01593 117 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IGKV1-33P01594 117 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IGHV3-7P01780 117 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RBP4P02753 201 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SFTPCP11686 197 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 IRF2P14316 349 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DAOP14920 347 aa4.6□□□□□ -1.67
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PTPRC-210ENST00000462363 ERVFRD-1P60508 538 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SPCS3P61009 180 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 RPL31P62899 125 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 AKR1C1Q04828 323 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 SLC38A11Q08AI6 406 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V1FQ16864 119 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 LTC4SQ16873 150 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 FAM74A3Q4VXF1 159 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM177Q53S58 311 aa4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
PTPRC-210ENST00000462363 OR4A47Q6IF82 309 aa4.6□□□□□ -1.67
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