RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 PF4P02776 101 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 APELAP0DMC3 54 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5H8P0DN80 308 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF182P17025 639 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HLA-DMAP28067 261 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GNRHRP30968 328 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MYCNOSP40205 109 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RAB9AP51151 201 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FXYD4P59646 89 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FXYD3Q14802 87 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 PLGLAQ15195 96 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 C10orf55Q5SWW7 151 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa5.43□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OVCH2Q7RTZ1 564 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GPR141Q7Z602 305 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PPP1R27Q86WC6 154 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX29P2Q8IUI4 249 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF695Q8IW36 515 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 COMMD1Q8N668 190 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR5T1Q8NG75 326 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 GIMAP1Q8WWP7 306 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HARBI1Q96MB7 349 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MS4A10Q96PG2 267 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD1Q96SE0 405 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FXYD6Q9H0Q3 95 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TAS2R8Q9NYW2 309 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TRAV3A0A0B4J244 114 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 NUDT19A8MXV4 375 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SPDEFO95238 335 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS3P35030 304 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HRH1P35367 487 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CBX5P45973 191 aa5.42□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC4P59998 168 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 DYRK1AQ13627 763 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 AKIRIN2Q53H80 203 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KCTD9Q7L273 389 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR11H1Q8NG94 326 aa5.42□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 GRPEL2Q8TAA5 225 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD5Q8WTS1 349 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 C4orf3Q8WVX3 66 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ARPC1AQ92747 370 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ADTRPQ96IZ2 230 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 CMTM3Q96MX0 182 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A7Q9GZV3 580 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IFT46Q9NQC8 304 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 NECAP2Q9NVZ3 263 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 EHFQ9NZC4 300 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 KLK11Q9UBX7 282 aa5.42□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP5.42□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 COL7A1Q02388 2944 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 A0A087WW49 117 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 HMX3A6NHT5 357 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MSGN1A6NI15 193 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM25AB3EWG3 89 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM25CB3EWG5 89 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM25GB3EWG6 89 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 K7EIL1 84 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 M0QYG6 137 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 SULT1C2O00338 296 aa5.41□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 SLURP1P55000 103 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2KP61086 200 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 FHL3Q13643 280 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 PRSS8Q16651 343 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 RTL8BQ17RB0 113 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF585BQ52M93 769 aa5.41□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 SSX9Q7RTT3 188 aa5.41□□□□□ -1.54
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RABGEF1-206ENST00000461017 LAX1Q8IWV1 398 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TEX45Q8NA69 505 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 OR4D10Q8NGI6 311 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 ACOT12Q8WYK0 555 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIM63Q969Q1 353 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 MOB3AQ96BX8 217 aa5.41□□□□□ -1.54
RABGEF1-206ENST00000461017 UBE2E2Q96LR5 201 aa5.41□□□□□ -1.54
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