RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423048.5

ALMS1-201, Transcript of ALMS1, centrosome and basal body associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ALMS1, Length 5,194 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALMS1-201ENST00000423048 RHOVQ96L33 236 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 C20orf24Q9BUV8 137 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 GNB4Q9HAV0 340 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DTX4Q9Y2E6 619 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM8BA6NDV4 472 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 C5orf52A6NGY3 159 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MPZL1O95297 269 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NTF3P20783 257 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ASIPP42127 132 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A45Q8N413 288 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OR4X2Q8NGF9 303 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PLXNA4Q9HCM2 1894 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SNURFLB1AK76 121 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 LINC00587B1AMM8 73 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 F2Z2F3 143 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 THY1P04216 161 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 BTCP35070 178 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 H2BFSP57053 126 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 KLRB1Q12918 225 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 FAM106AQ4KMX7 169 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RGP1Q92546 391 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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ALMS1-201ENST00000423048 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 WDR83OSQ9Y284 106 aa6.06□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ERVH48-1M5A8F1 160 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PDCD1Q15116 288 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PRR27Q6MZM9 219 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CLDND2Q8NHS1 167 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OR4C12Q96R67 309 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RSG1Q9BU20 258 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 FSCN3Q9NQT6 498 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RPS27P42677 84 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ZP1P60852 638 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 UNC119Q13432 240 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF525Q8N782 197 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TMEM37Q8WXS4 190 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DIRC3C9JPN6 131 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PIGYQ3MUY2 71 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SLC25A34Q6PIV7 304 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DRAM1Q8N682 238 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 UCN2Q96RP3 112 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 TNFRSF19Q9NS68 423 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ONECUT1Q9UBC0 465 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NYNRINQ9P2P1 1898 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NUDT3O95989 172 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SP9P0CG40 484 aa6.05□□□□□ -1.44
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ALMS1-201ENST00000423048 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF383Q8NA42 475 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SLX1AQ9BQ83 275 aa6.05□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 C15orf61A6NNL5 157 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 IGHG3P01860 377 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 REG1AP05451 166 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CFHR2P36980 270 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OR1N2Q8NGR9 330 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 MS4A3Q96HJ5 214 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NPCDR1Q9BY65 106 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 FAM221AA4D161 298 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 M0R1W7 72 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ZIC3O60481 467 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 LYZP61626 148 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PRCDQ00LT1 54 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DOCK4Q8N1I0 1966 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 EBLN2Q6P2I7 272 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 OVOL2Q9BRP0 275 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 C4orf51C9J302 202 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 SIGLEC5O15389 551 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 KLK10O43240 276 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NEURL1O76050 574 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 NAPSAO96009 420 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 IGHV3-13P01766 116 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 EDN3P14138 238 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 DDTP30046 118 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PPOXP50336 477 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 PDE6HQ13956 83 aa6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
ALMS1-201ENST00000423048 Q8NFD4 153 aa6.04□□□□□ -1.44
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