RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMSQ5H8A3 153 aa13.59□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa13.59□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR11H7Q8NGC8 314 aa13.59□□□□□ -0.23
TOP3BP1-201ENST00000420768 VSTM2AQ8TAG5 236 aa13.59□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 SPIN2AQ99865 258 aa13.59□□□□□ -0.23
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RITA1Q96K30 269 aa13.58□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM140Q9NV12 185 aa13.58□□□□□ -0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR2A4O95047 310 aa13.57□□□□□ -0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 CACFD1Q9UGQ2 172 aa13.57□□□□□ -0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MPTX1A8MV57 137 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 HNF4GQ14541 408 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SMCO1Q147U7 214 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 PSG5Q15238 335 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MMDQ15546 238 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 Q6YL49 198 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR5R1Q8NH85 324 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZDHHC16Q969W1 377 aa13.56□□□□□ -0.24
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TOP3BP1-201ENST00000420768 OR10C1Q96KK4 312 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 C1RLQ9NZP8 487 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1456Q9P272 454 aa13.56□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 H3BUX3 64 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 RRHO14718 337 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NBR2O15453 112 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLC25A17O43808 307 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SNAPC5O75971 98 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 KBTBD11O94819 623 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NDUFA3O95167 84 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 SIX6O95475 246 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 GIPP09681 153 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 IER3P46695 156 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 OR4A16Q8NH70 328 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMES1Q9C002 83 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 CACNG5Q9UF02 275 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCF19Q9Y242 345 aa13.55□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 BTBD17A6NE02 478 aa13.54□□□□□ -0.24
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPK2O00526 184 aa13.54□□□□□ -0.24
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