RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 COMMD3Q9UBI1 195 aa6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAM30Q9UKF2 790 aa6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ANAPC10Q9UM13 185 aa6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RABL2BQ9UNT1 228 aa6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.62□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 J3QRK9 145 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2A4O95047 310 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 IGLV2-14P01704 120 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SMIM18P0DKX4 95 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 S100GP29377 79 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ALDH3B2P48448 385 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 GNB1P62873 340 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 GPR107Q5VW38 600 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 CMTM1Q8IZ96 169 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR4A5Q8NH83 315 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 GRPEL2Q8TAA5 225 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 GPX8Q8TED1 209 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SNAPC3Q92966 411 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 USMG5Q96IX5 58 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR2A7Q96R45 310 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 CCL28Q9NRJ3 127 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF355PQ9NSJ1 428 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 EHFQ9NZC4 300 aa6.61□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 MSGN1A6NI15 193 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM25AB3EWG3 89 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM25CB3EWG5 89 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM25GB3EWG6 89 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01619G3V211 115 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SOX15O60248 233 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 HPRT1P00492 218 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TRGV3P03979 118 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FGF2P09038 288 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR9G9P0C7N8 305 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ELK1P19419 428 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ZP3P21754 424 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RCVRNP35243 200 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TMBIM6P55061 237 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB25P57735 213 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TPPP2P59282 170 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL30P62888 115 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 DGCR2P98153 550 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 EIF4EBP1Q13541 118 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TNXAQ16473 311 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 DEFB136Q30KP8 78 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF429Q86V71 674 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM17Q86X19 198 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 CADM3Q8N126 398 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 MRAPQ8TCY5 172 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB2BQ8WUD1 216 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 MOB3AQ96BX8 217 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RHOVQ96L33 236 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 PHB2Q99623 299 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 GNB4Q9HAV0 340 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TPSG1Q9NRR2 321 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.6□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 MPPED1O15442 326 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 KBTBD11O94819 623 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 DHFRP00374 187 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 PTHLHP12272 177 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 NQO2P16083 231 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TBPP20226 339 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RFX2P48378 723 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TAS2R31P59538 309 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 FXYD4P59646 89 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TSPAN5P62079 268 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 RPL8P62917 257 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SSBP2P81877 361 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 POU2AF1Q16633 256 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 LYSMD2Q8IV50 215 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 SPAG16Q8N0X2 631 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 OR5T1Q8NG75 326 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 MS4A10Q96PG2 267 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 DUX3Q96PT4 197 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ELOVL1Q9BW60 279 aa6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms