RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378017.7

MTSS1-202, Transcript of MTSS1, I-BAR domain containing, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MTSS1, Length 4,458 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTSS1-202ENST00000378017 ACSM6Q6P461 480 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 ACP7Q6ZNF0 438 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 Q6ZT83 130 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 NAGKQ9UJ70 344 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 ZNF835Q9Y2P0 537 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 PRR33A8MZF0 331 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 WNT9BO14905 357 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 MT-ND6P03923 174 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 TCL1AP56279 114 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 TFF3Q07654 80 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 TCF19Q9Y242 345 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 CACNA1DQ01668 2161 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 CACNA1EQ15878 2313 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 IQCF6A8MYZ5 107 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 NEURL1O76050 574 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 HSPE1P61604 102 aaKnown RBP8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 PAX5Q02548 391 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 SPSB3Q6PJ21 355 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 PCSK4Q6UW60 755 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 TMEM108Q6UXF1 575 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 BMPERQ8N8U9 685 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 OR4X1Q8NH49 305 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 RNF138Q8WVD3 245 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 SFRP2Q96HF1 295 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 THADAQ6YHU6 1953 aa8.73□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 ZNF883P0CG24 379 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 PSG7Q13046 419 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 SSC4DQ8WTU2 575 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 OR2V2Q96R30 315 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 VSIRQ9H7M9 311 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 CALYQ9NYX4 217 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 USF1P22415 310 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 ERVFRD-1P60508 538 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 RTP5Q14D33 572 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 TPPP3Q9BW30 176 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 TMPRSS2O15393 492 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 CT45A10P0DMU9 189 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 PQLC2Q6ZP29 291 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 HSPB7Q9UBY9 170 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 HIST3H2BBQ8N257 126 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 OR1L8Q8NGR8 309 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 HARBI1Q96MB7 349 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.72□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 BRS3P32247 399 aa8.71□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 WNT5AP41221 380 aa8.71□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 HERPUD1Q15011 391 aa8.71□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 ABHD12Q8N2K0 398 aa8.71□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 LINC00469Q8N7U9 141 aa8.71□□□□□ -1.01
MTSS1-202ENST00000378017 AHRRA9YTQ3 701 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 EGR1P18146 543 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 RNASEKQ6P5S7 137 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 COLCA1Q6ZS62 124 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 LRP11Q86VZ4 500 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 PDPNQ86YL7 162 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 OR13A1Q8NGR1 328 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 MISP3Q96FF7 219 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 LOXL4Q96JB6 756 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 PROK2Q9HC23 129 aa8.71□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 H0Y8G0 127 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 IGKV1-5P01602 117 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 Q0VFX4 171 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 VN1R17PQ8TDU5 208 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 FAM216AQ8WUB2 273 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 TMEM170AQ8WVE7 144 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 HSPB9Q9BQS6 159 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 M0R296 226 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 RAMP3O60896 148 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 GCHFRP30047 84 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 CSN1S1P47710 185 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 ZNF146Q15072 292 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 DEFB124Q8NES8 71 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 STXBP6Q8NFX7 210 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 OR5R1Q8NH85 324 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 WDYHV1Q96HA8 205 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 PAM16Q9Y3D7 125 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 MKRN2OSH3BPM6 223 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 CD55P08174 381 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 CELA3BP08861 270 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 C10orf113Q5VZT2 155 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 PI4KAP42356 2102 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 OR8I2Q8N0Y5 310 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 STPG3Q8N7X2 389 aa8.7□□□□□ -1.02
MTSS1-202ENST00000378017 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.7□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms