RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PRD5 423 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PRF3 423 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PRM7 423 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RBP4P02753 201 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MMP9P14780 707 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MYOD1P15172 320 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF137PP52743 207 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RELBQ01201 579 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR4A47Q6IF82 309 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HCP5Q6MZN7 132 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM217Q8N7C4 229 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR5AN1Q8NGI8 311 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FAM168AQ92567 244 aa12.45□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PPE2 198 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PR64 198 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 A0A1W2PRV1 198 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G2AP14555 144 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PAX6P26367 422 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 DYNLT3P51808 116 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ERVK-16P61578 105 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PAX2Q02962 417 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 BAP18Q8IXM2 172 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR4P4Q8NGL7 312 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR4A16Q8NH70 328 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RAB40CQ96S21 281 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 GSX2Q9BZM3 304 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 POLQO75417 2590 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PLXNB1O43157 2135 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ABCA2Q9BZC7 2435 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A26D6RGX4 464 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TAAR5O14804 337 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TXNL1O43396 289 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RPS16P62249 146 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CLINT1Q14677 625 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RTL8BQ17RB0 113 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 BEND2Q8NDZ0 799 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 STOML3Q8TAV4 291 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 C10orf105Q8TEF2 133 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SMIM8Q96KF7 97 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LPAR2Q9HBW0 351 aa12.44□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FAM157AC9JC47 383 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SHOXO15266 292 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TPT1P13693 172 aaKnown RBP12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PRTN3P24158 256 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ARL16Q0P5N6 197 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SPANXN5Q5MJ07 72 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TNFRSF14Q92956 283 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LHX4Q969G2 390 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 SLC25A31Q9H0C2 315 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 WSB1Q9Y6I7 421 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CSMD1Q96PZ7 3565 aa12.43□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 M0R1W7 72 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HRASP01112 189 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IFNA17P01571 189 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 APOA2P02652 100 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ARG1P05089 322 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 METTL15P1P0C7V9 234 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NDUFA5Q16718 116 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CLLU1Q5K131 121 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF787Q6DD87 383 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FAM71F2Q6NXP2 309 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 VMO1Q7Z5L0 202 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HAPLN4Q86UW8 402 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR5C1Q8NGR4 320 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TMED6Q8WW62 240 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 RFNGQ9Y644 331 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CEBPZOSA8MTT3 80 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LY6LH3BQJ8 138 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ENSAO43768 121 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FBXO24O75426 580 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 NMBP08949 121 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IL3RAP26951 378 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 DTD1Q8TEA8 209 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 PIMREGQ9BSJ6 248 aa12.42□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 VWC2LB2RUY7 222 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MED6O75586 246 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OPN1MWP04001 364 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OPN1MW2P0DN77 364 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OPN1MW3P0DN78 364 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 POU2AF1Q16633 256 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 TMEM177Q53S58 311 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 MOB3BQ86TA1 216 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 CXorf58Q96LI9 332 aa12.41□□□□□ -0.42
CASQ1-201ENST00000368078 HARBI1Q96MB7 349 aa12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms