RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 HERV-K104P61576 105 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MSMO1Q15800 293 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ASPHD1Q5U4P2 390 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 DHRS11Q6UWP2 260 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TEX45Q8NA69 505 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 C4orf3Q8WVX3 66 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MOB3AQ96BX8 217 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ISOC1Q96CN7 298 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CCL24O00175 119 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SULT1C2O00338 296 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RGS5O15539 181 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RAMP3O60896 148 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SLC6A1P30531 599 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 GNRHRP30968 328 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RCVRNP35243 200 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MYCNOSP40205 109 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PRSS8Q16651 343 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 AKIRIN2Q53H80 203 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ACTBL2Q562R1 376 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM65Q6PI78 240 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZBTB34Q8NCN2 500 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR52I2Q8NH67 350 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR4S2Q8NH73 311 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR5B12Q96R08 314 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ABHD1Q96SE0 405 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CEPT1Q9Y6K0 416 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 NOL3O60936 208 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 CNIH1O95406 144 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TNXAQ16473 311 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 C10orf55Q5SWW7 151 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR51H1Q8NH63 302 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 UBE2E2Q96LR5 201 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 MS4A10Q96PG2 267 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF430Q9H8G1 570 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 KLK11Q9UBX7 282 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SCOCQ9UIL1 159 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 TNCP24821 2201 aa11.6□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 I3L521 148 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 M0QYG6 137 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 APELAP0DMC3 54 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 KIR2DS2P43631 304 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SSX9Q7RTT3 188 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SPAG16Q8N0X2 631 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR5T1Q8NG75 326 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 OR5M8Q8NGP6 311 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SRSF12Q8WXF0 261 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 VSIG4Q9Y279 399 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG1-201ENST00000361211 RLN1P04808 185 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RAB25P57735 213 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DGCR2P98153 550 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DEFA5Q01523 94 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CATR1Q13166 79 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 FHL3Q13643 280 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 AADACL3Q5VUY0 350 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 FOXB2Q5VYV0 432 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR11H1Q8NG94 326 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR6F1Q8NGZ6 308 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP11.58□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MSGN1A6NI15 193 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 KBTBD11O94819 623 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 IGHV3-11P01762 117 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TPPP2P59282 170 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TSPAN5P62079 268 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RUNX1Q01196 453 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 VAX1Q5SQQ9 334 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PYHIN1Q6K0P9 492 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 POC5Q8NA72 575 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RHOVQ96L33 236 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PHB2Q99623 299 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RBM38Q9H0Z9 239 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MTFP1Q9UDX5 166 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 GPR31O00270 319 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PGLYRP1O75594 196 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TPPPO94811 219 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR2A4O95047 310 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 S1PR2O95136 353 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TRGV3P03979 118 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 CD3DP04234 171 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MYOD1P15172 320 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 PHLDA2Q53GA4 152 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 MMD2Q8IY49 270 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR4D10Q8NGI6 311 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 DIRAS2Q96HU8 199 aa11.56□□□□□ -0.56
CSAG1-201ENST00000361211 OR2A7Q96R45 310 aa11.56□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 161 ms