RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC25A33Q9BSK2 321 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 IL36RNQ9UBH0 155 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 AKAP6Q13023 2319 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MEF2CQ06413 473 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM97Q5BJF2 176 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC16A13Q7RTY0 426 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF436-AS1Q8NC38 126 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C19orf24Q9BVV8 132 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C17orf100A8MU93 164 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TM4SF20Q53R12 229 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LAMTOR1Q6IAA8 161 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LRP11Q86VZ4 500 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FXYD3Q14802 87 aa13.86□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MGPP08493 103 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NMBP08949 121 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C8orf88P0DMB2 117 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL7P18124 248 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 IER3P46695 156 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LY6EQ16553 131 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SPACA3Q8IXA5 215 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PLAUP00749 431 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SGMS2Q8NHU3 365 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 H2BFSP57053 126 aa13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 AURKAIP1Q9NWT8 199 aaPredicted RBP13.85□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PGPA6NDG6 321 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 C1QL1O75973 258 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00271P0C7V0 271 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TFPI2P48307 235 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ATP5G2Q06055 141 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 GUCA2BQ16661 112 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM216BQ8N7L0 139 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 OR51G1Q8NGK1 321 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FUT9Q9Y231 359 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 SCN5AQ14524 2016 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 GREB1Q4ZG55 1949 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 A0A0G2JK05 382 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 NDUFB4O95168 129 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 FCGR2BP31994 310 aaPredicted RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 MFAP2P55001 183 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF738Q8NE65 137 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 TUSC1Q2TAM9 212 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 RAB24Q969Q5 203 aa13.84□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 LYPD3O95274 346 aa13.83□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF137PP52743 207 aa13.83□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 WDFY1Q8IWB7 410 aa13.83□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 PLSCR2Q9NRY7 297 aa13.83□□□□□ -0.19
SH3BP4-201ENST00000344528 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 E9PLN8 166 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 APCSP02743 223 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SNRPCP09234 159 aaKnown RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 HERVK_113P61574 105 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 Q6ZN92 141 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 WBP1Q96G27 269 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TP53RKQ96S44 253 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 VKORC1Q9BQB6 163 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RTN4RQ9BZR6 473 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM189A5PLL7 270 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 G0S2P27469 103 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 GALNT14Q96FL9 552 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGEF17Q96PE2 2063 aaPredicted RBP13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa13.83□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 PQLC2LA1A4F0 135 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RND3P61587 244 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RELQ04864 619 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RPL39P5Q59GN2 51 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RNFT1Q5M7Z0 435 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 RTN4RL2Q86UN3 420 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CELA3BP08861 270 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 GATAD1Q8WUU5 269 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM168AQ92567 244 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 HSPB7Q9UBY9 170 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 ESPL1Q14674 2120 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 CHD5Q8TDI0 1954 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 MT-ND6P03923 174 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM201AQ5SY85 155 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 OR13A1Q8NGR1 328 aa13.82□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 A1L4Q6 167 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 UCP1P25874 307 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 NPIPB3Q92617 1050 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 PSG9Q00887 426 aa13.81□□□□□ -0.2
SH3BP4-201ENST00000344528 SMAGPQ0VAQ4 97 aa13.81□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms