RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000336070.11

FRMD1-202, Transcript of FERM domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene FRMD1, Length 1,600 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD1-202ENST00000336070 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 CSMD1Q96PZ7 3565 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 PITX3O75364 302 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 SNAPC5O75971 98 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 AVPP01185 164 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 PSMB6P28072 239 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 RPS16P62249 146 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 CD300CQ08708 224 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 NANPQ8TBE9 248 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 CFHR4Q92496 578 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 HARBI1Q96MB7 349 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 MEGF9Q9H1U4 602 aa14.74□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 A0A0G2JRQ6 117 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 IL6RP08887 468 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 FGF2P09038 288 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 PET100P0DJ07 73 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 EBI3Q14213 229 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 OR4D5Q8NGN0 318 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 HYLS1Q96M11 299 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 TSNAXQ99598 290 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 BET1LQ9NYM9 111 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa14.73□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 FAM90A26D6RGX4 464 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 RLN2P04090 185 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 DYNLT3P51808 116 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 ID3Q02535 119 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 ZFP69Q49AA0 526 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 Q6ZRM9 215 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 OR4A5Q8NH83 315 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 CACNG5Q9UF02 275 aa14.72□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 SRRM4A7MD48 611 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 ST8SIA3O43173 380 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 VENTXO95231 258 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 MPC2O95563 127 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 FAM106CPP0CH98 169 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 NKX2-1P43699 371 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 VMA21Q3ZAQ7 101 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 AARDQ4LEZ3 155 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 OR4A47Q6IF82 309 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 DYNAPQ8N1N2 210 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 OR1S1Q8NH92 325 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM140Q9NV12 185 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 NUP50Q9UKX7 468 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 FAM96BQ9Y3D0 163 aa14.71□□□□□ -0.05
FRMD1-202ENST00000336070 SMAD7O15105 426 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 MOSP00540 346 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 UBE2KP61086 200 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 ZNF429Q86V71 674 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 TEX45Q8NA69 505 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 OR4A16Q8NH70 328 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 THAP6Q8TBB0 222 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 FKBP11Q9NYL4 201 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 NOTCH2Q04721 2471 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 CR1P17927 2039 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 CD5LO43866 347 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SPDEFO95238 335 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 FSHBP01225 129 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 FBP1P09467 338 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SLC25A4P12235 298 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 AANATQ16613 207 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 C11orf87Q6NUJ2 197 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SSX9Q7RTT3 188 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 NOXA1Q86UR1 476 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 FOXRED2Q8IWF2 684 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 VKORC1L1Q8N0U8 176 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 C17orf50Q8WW18 174 aa14.7□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 G3V3Q6 166 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 IGLV2-23P01705 113 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RELBQ01201 579 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RAB32Q13637 225 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 TMEM65Q6PI78 240 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 C9orf139Q6ZV77 190 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 OR8H1Q8NGG4 311 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 OR52E5Q8NH55 327 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PRNDQ9UKY0 176 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 POMT1Q9Y6A1 747 aa14.69□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 HMSDA8MTL9 139 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 UPK2O00526 184 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 LY86O95711 162 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 IGKV1D-33P01593 117 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 IGKV1-33P01594 117 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 SAA1P0DJI8 122 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 Q5BKY6 102 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 PRSS54Q6PEW0 395 aa14.68□□□□□ -0.06
FRMD1-202ENST00000336070 NPBQ8NG41 125 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms