RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 ZFP82Q8N141 532 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF561Q8N587 486 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 GCSAMQ8N6F7 178 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF525Q8N782 197 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 C15orf54Q8N8G6 183 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 PSENENQ9NZ42 101 aa13.08□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 GPR37O15354 613 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 RAMP3O60896 148 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 DFFBO76075 338 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV2-5P01817 119 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 GZMHP20718 246 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 NPBWR1P48145 328 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 HTD2P86397 168 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 EDDM3AQ14507 147 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 WFDC11Q8NEX6 87 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TCTEX1D2Q8WW35 142 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SNX22Q96L94 193 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 LHBP01229 141 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ADH4P08319 380 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 IAPPP10997 89 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R60P59551 318 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CATR1Q13166 79 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ANKRD39Q53RE8 183 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1R35Q8TAP8 253 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 PFDN5Q99471 154 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 MYO9AB2RTY4 2548 aa13.07□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ODAMA1E959 279 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 MGST3O14880 152 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC31A2O15432 143 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 IFNA5P01569 189 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 DAOP14920 347 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 BRWD1-AS2P59051 145 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TAS2R30P59541 319 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC12BQ2HXU8 276 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 BTNL3Q6UXE8 466 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 OTOGQ6ZRI0 2925 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ITLN1Q8WWA0 313 aa13.06□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 C17orf98A8MV24 154 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM90A26D6RGX4 464 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 KRASP01116 189 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 G6PCP35575 357 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 RUNX1Q01196 453 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TCTEX1D1Q8N7M0 179 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 LFNGQ8NES3 379 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 Q96MF0 132 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SAP30LQ9HAJ7 183 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 PSG11Q9UQ72 335 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 METTL15P1P0C7V9 234 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 P0C879 139 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 COL8A2P25067 703 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 PPT1P50897 306 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CR1LQ2VPA4 569 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 DNLZQ5SXM8 178 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF66Q6ZN08 573 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 AGMATQ9BSE5 352 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 PBDC1Q9BVG4 233 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 KPTNQ9Y664 436 aa13.05□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GV50 99 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1B0GW64 132 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 S1PR2O95136 353 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 UBE2KP61086 200 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ARL16Q0P5N6 197 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 LTC4SQ16873 150 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNRF1Q8ND25 227 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 RBKSQ9H477 322 aa13.04□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFSF4P23510 183 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 GATA4P43694 442 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CCL20P78556 96 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 TNFRSF9Q07011 255 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 FABP9Q0Z7S8 132 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC25A24Q6NUK1 477 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SPSB3Q6PJ21 355 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CLEC2AQ6UVW9 174 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SSX9Q7RTT3 188 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 HAPLN4Q86UW8 402 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SCGB1C1Q8TD33 95 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 DIRC2Q96SL1 478 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 CREBBPQ92793 2442 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 LRRC30A6NM36 301 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 NFYBP25208 207 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 MORN2Q502X0 79 aa13.03□□□□□ -0.32
TSNARE1-201ENST00000307180 SPANXN5Q5MJ07 72 aa13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms