RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 SAA2-SAA4A0A096LPE2 208 aa9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 FAM24AA6NFZ4 105 aa9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 OR2F2O95006 317 aa9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 GOSR1O95249 250 aa9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 F12P00748 615 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 IAPPP10997 89 aa9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 HTD2P86397 168 aa9.02□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 CDPF1Q6NVV7 123 aa9.02□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 hADV38S2A0JD32 116 aa9.01□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 C5orf52A6NGY3 159 aa9.01□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 DEDDO75618 318 aa9.01□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 S100A7AQ86SG5 101 aa9.01□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 ZNF714Q96N38 554 aa9.01□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 PRO1933Q9H354 126 aa9.01□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 MED9Q9NWA0 146 aa9.01□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa9.01□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PRD5 423 aa9□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PRF3 423 aa9□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1W2PRM7 423 aa9□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 A6NNC1 897 aa9□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 CHST1O43916 411 aa9□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 RBMXL2O75526 392 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 DMBX1Q8NFW5 382 aa9□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 RXFP4Q8TDU9 374 aa9□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 JPT1Q9UK76 154 aa9□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 OPN1MW2P0DN77 364 aa8.98□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 AGAP20933 346 aa8.98□□□□□ -0.97
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GGPS1-201ENST00000282841 TRAT1Q6PIZ9 186 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 TMED6Q8WW62 240 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 FBXL17Q9UF56 701 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 A0A0D9SG52 128 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 C22orf46C9J442 243 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV1-16P04430 117 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 IGFBP2P18065 325 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 ARF6P62330 175 aa8.98□□□□□ -0.97
GGPS1-201ENST00000282841 RBX1P62877 108 aa8.98□□□□□ -0.97
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