RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000272638.13

UBXN4-201, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBXN4, Length 4,006 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-201ENST00000272638 C16orf82Q7Z2V1 217 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 OR4S2Q8NH73 311 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 MUC3AQ02505 3323 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 TNFRSF1AP19438 455 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ICAM4Q14773 271 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 MOB3BQ86TA1 216 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SAMD10Q9BYL1 202 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 DCAF16Q9NXF7 216 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PLXNB1O43157 2135 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ADH4P08319 380 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 COQ2Q96H96 371 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PRO3102Q9H379 93 aa10.5□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LINC00473A8K010 186 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 C16orf97H3BN30 126 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 NDUFB3O43676 98 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CNIH1O95406 144 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LYL1P12980 280 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 NPY1RP25929 384 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 OPRK1P41145 380 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 FUT9Q9Y231 359 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 A8MXE2 369 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV1-39P01597 117 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 IGKV1D-39P04432 117 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 OR4A8P0C604 315 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 RBPJQ06330 500 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF585BQ52M93 769 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 C1orf185Q5T7R7 199 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ABHD17AQ96GS6 310 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 MEGF10Q96KG7 1140 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SGK494Q96LW2 274 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 HARBI1Q96MB7 349 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 J3QR06 171 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 S100A8P05109 93 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 REG1AP05451 166 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CLDND2Q8NHS1 167 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 STARD4Q96DR4 205 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PCGF1Q9BSM1 259 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 TRAV3A0A0B4J244 114 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CCL3L1P16619 93 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PSG5Q15238 335 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CD177Q8N6Q3 437 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 Q8WTZ3 238 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 MISP3Q96FF7 219 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SLC35E1Q96K37 410 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 NGBQ9NPG2 151 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SSUH2Q9Y2M2 353 aa10.49□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 HRASP01112 189 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ERVFC1-1P60608 527 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SERF2P84101 59 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SLC35E4Q6ICL7 350 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 Q6ZR03 302 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 IL22RA2Q969J5 263 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PXMP4Q9Y6I8 212 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 hADV38S2A0JD32 116 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 FAM157AC9JC47 383 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 FAM87AP0C7U9 286 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CHRNB4P30926 498 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 BAGE3Q86Y29 109 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 BAGE2Q86Y30 109 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 BLNKQ8WV28 456 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 TCF19Q9Y242 345 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 HPRT1P00492 218 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 OR9G9P0C7N8 305 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ORM2P19652 201 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PAX9P55771 341 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 TPPP3Q9BW30 176 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 PARLQ9H300 379 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 NAT8Q9UHE5 227 aa10.48□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 XKRY2A2RUG3 117 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LYNX1G3V0Z9 82 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LYNX1P0DP58 116 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CD82P27701 267 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ERHP84090 104 aaKnown RBP10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 DEFA6Q01524 100 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 HCP5Q6MZN7 132 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 OR10A7Q8NGE5 316 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LOC102723971A0A1B0GUV8 181 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 H3BTX0 84 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 WDR31Q8NA23 367 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ZBTB34Q8NCN2 500 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 SLC31A2O15432 143 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 CXCL1P09341 107 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ATP5G3P48201 142 aa10.47□□□□□ -0.73
UBXN4-201ENST00000272638 ZNF146Q15072 292 aa10.47□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms