RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YAE1D1Q9NRH1 226 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CACNG5Q9UF02 275 aa16.51■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 E5RGE8 158 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KRASP01116 189 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GATA3P23771 443 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COX7A1P24310 79 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL3RAP26951 378 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 G6PCP35575 357 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AP2S1P53680 142 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRRX1P54821 245 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ID3Q02535 119 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q6ZRM9 215 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 Q71RC1 249 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLEC7AQ9BXN2 247 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COA4Q9NYJ1 87 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NSG2Q9Y328 171 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CT45A6P0DMU7 189 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CT45A5P0DMU8 189 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CT45A7P0DMV0 189 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRTN3P24158 256 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 R3HDM4Q96D70 268 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AQP10Q96PS8 301 aa16.5■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PRD5 423 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PRF3 423 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 A0A1W2PRM7 423 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BEND2Q8NDZ0 799 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LHX4Q969G2 390 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa16.49■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MARCH11A6NNE9 402 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGLV1-47P01700 117 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FOSL1P15407 271 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HCP5Q6MZN7 132 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CLEC9AQ6UXN8 241 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 H2BFWTQ7Z2G1 175 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PNKDQ8N490 385 aa16.48■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 J3QLI3 93 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KCNAB3O43448 404 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NQO2P16083 231 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HLA-DRB5Q30154 266 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MIDNQ504T8 468 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DHRS7BQ6IAN0 325 aaPredicted RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL17RELQ6ZVW7 336 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DMBX1Q8NFW5 382 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C11orf1Q9H5F2 150 aa16.47■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MSGN1A6NI15 193 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM90A26D6RGX4 464 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WRBO00258 174 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BCL2L11O43521 198 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RRASP10301 218 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 P2RY1P47900 373 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARHGDIBP52566 201 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ERVK-16P61578 105 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RTL8BQ17RB0 113 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC35D1Q9NTN3 355 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NAV3Q8IVL0 2385 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TRAV40A0A0B4J280 105 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CRYZL1O95825 349 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 APOA2P02652 100 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HKR1P10072 659 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RPL12P30050 165 aaKnown RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NABP2Q9BQ15 211 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAGT1Q9H0U3 335 aa16.46■□□□□ 0.23
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SSSCA1O60232 199 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR8H1Q8NGG4 311 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR5AN1Q8NGI8 311 aa16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP16.45■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NXPH3O95157 252 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 REG1BP48304 166 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VAMP2P63027 116 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TEX261Q6UWH6 196 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF767PQ75MW2 155 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SLC51BQ86UW2 128 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 OR11H6Q8NGC7 330 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARPC5LQ9BPX5 153 aa16.44■□□□□ 0.22
SH3BGRL3-201ENST00000270792 U3KQ87 197 aa16.44■□□□□ 0.22
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