RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262460.4

GINS1-201, Transcript of GINS complex subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GINS1, Length 3,249 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS1-201ENST00000262460 OR2V2Q96R30 315 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PARLQ9H300 379 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GPR12P47775 334 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GAMTQ14353 236 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMEM41BQ5BJD5 291 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TCF23Q7RTU1 214 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 R3HDM4Q96D70 268 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF251Q9BRH9 671 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 DKK4Q9UBT3 224 aa7.2□□□□□ -1.26
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GINS1-201ENST00000262460 AHRRA9YTQ3 701 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 FOXH1O75593 365 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C1QTNF9P0C862 333 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SLC25A6P12236 298 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR10P1Q8NGE3 313 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ITLN1Q8WWA0 313 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 STARD4Q96DR4 205 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 AGMATQ9BSE5 352 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IER2Q9BTL4 223 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 NPCDR1Q9BY65 106 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SDF2L1Q9HCN8 221 aa7.2□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TNFSF13O75888 250 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CLDN14O95500 239 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 LGALS4P56470 323 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CCL8P80075 99 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 WIPI2Q9Y4P8 454 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 NDUFB4O95168 129 aa7.19□□□□□ -1.26
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GINS1-201ENST00000262460 GCSAMQ8N6F7 178 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CCL13Q99616 98 aa7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CTNNBIP1Q9NSA3 81 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OOEPA6NGQ2 149 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C15orf62A8K5M9 175 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PMS2P5A8MQ11 134 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HOXA5P20719 270 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 RPL23P62829 140 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GNB2P62879 340 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SLC35B1P78383 322 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C1QL4Q86Z23 238 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR4X1Q8NH49 305 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMEM170AQ8WVE7 144 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IL22RA2Q969J5 263 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HSPB7Q9UBY9 170 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 VAX2Q9UIW0 290 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 FUT9Q9Y231 359 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IGKV3-15P01624 115 aa7.18□□□□□ -1.26
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GINS1-201ENST00000262460 S100A2P29034 98 aa7.18□□□□□ -1.26
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GINS1-201ENST00000262460 PFDN5Q99471 154 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CXXC4Q9H2H0 198 aa7.18□□□□□ -1.26
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GINS1-201ENST00000262460 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CLDN34H7C241 214 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TM4SF5O14894 197 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PPP1R2P9O14990 202 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SMIM6P0DI80 62 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PAX6P26367 422 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CTAG1AP78358 180 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF718Q3SXZ3 478 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 TMUB1Q9BVT8 246 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GFOD1Q9NXC2 390 aa7.18□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 DUXBA0A1W2PPF3 345 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C11orf94C9JXX5 98 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C15orf65H3BRN8 121 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IGKV1-16P04430 117 aa7.17□□□□□ -1.26
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GINS1-201ENST00000262460 FAM78BQ5VT40 261 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C19orf35Q6ZS72 473 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 LINC00596Q86U02 117 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 C1orf87Q8N0U7 546 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF709Q8N972 641 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 IMMP2LQ96T52 175 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 OR6C3Q9NZP0 311 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 SLC17A3O00476 420 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ZNF883P0CG24 379 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 ARL14EPLP0DKL9 152 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CD82P27701 267 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 DUTP33316 252 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 GALR1P47211 349 aa7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP7.17□□□□□ -1.26
GINS1-201ENST00000262460 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa7.17□□□□□ -1.26
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