RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 CDKN1AP38936 164 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 C20orf204Q6ZNR8 217 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 MUC15Q8N387 334 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PYGO2Q9BRQ0 406 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 PKIBQ9C010 78 aa21.9■■□□□ 1.1
CAPNS1-201ENST00000246533 TNFSF12O43508 249 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 REC114Q7Z4M0 266 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP11Q86VZ4 500 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NUP37Q8NFH4 326 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RSG1Q9BU20 258 aa21.89■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 DVL1O14640 695 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 OR4A8P0C604 315 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF726P1Q15940 193 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CYP2G1PQ6ZSU1 146 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM183AQ8IXX5 376 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LILRB2Q8N423 598 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5P3Q8WZ94 311 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNG5Q9UF02 275 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM250H0YL14 139 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NXPH3O95157 252 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP4P15090 132 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 LCN15Q6UWW0 184 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GPHA2Q96T91 129 aa21.88■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF212BA8MTL3 300 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFS7O75251 213 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA46Q5T0L3 261 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 BATF2Q8N1L9 274 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 OR51H1Q8NH63 302 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa21.87■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BP45 60 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG3P63215 75 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1FQ16864 119 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf71Q6IPW1 123 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 DTX2Q86UW9 622 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM58AQ8N1B3 248 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CEBPZOSA8MTT3 80 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MBP02144 154 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM241Q24JQ0 296 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GFI1BQ5VTD9 330 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 C14orf144Q96I85 54 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 HIST1H2BLQ99880 126 aa21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP21.86■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV24A0A0B4J272 114 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SMPD2O60906 423 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PAX1P15863 534 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 DDTP30046 118 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GLRXP35754 106 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB113Q30KQ7 82 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NCR3LG1Q68D85 454 aa21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 HSPB6O14558 160 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF737O75373 536 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 METTL15P1P0C7V9 234 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 RD3LP0DJH9 198 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 Q6ZRM9 215 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC39A9Q9NUM3 307 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IL36RNQ9UBH0 155 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 OVOL3O00110 214 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SYNGR1O43759 233 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 KBTBD11O94819 623 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-39P01597 117 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1D-39P04432 117 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf24Q7Z6I8 188 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 NINJ1Q92982 152 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PERPQ96FX8 193 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 ACY3Q96HD9 319 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 CBLN4Q9NTU7 201 aa21.84■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PFN1P07737 140 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 PGA5P0DJD9 388 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 GAMTQ14353 236 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 SMIM7Q9BQ49 75 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 VSIRQ9H7M9 311 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 MANBALQ9NQG1 85 aa21.83■■□□□ 1.09
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV1-5P01602 117 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 FGF7P21781 194 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 PSMB3P49720 205 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 CDPF1Q6NVV7 123 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8IYB0 196 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 LHX4Q969G2 390 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ANAPC16Q96DE5 110 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5B12Q96R08 314 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2J1Q9GZK6 312 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 DUSP13Q9UII6 198 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ARL16Q0P5N6 197 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 HAPLN4Q86UW8 402 aa21.82■■□□□ 1.08
CAPNS1-201ENST00000246533 ZBTB34Q8NCN2 500 aa21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms