RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229307.8

NANOG-201, Transcript of Nanog homeobox, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NANOG, Length 5,183 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOG-201ENST00000229307 DRAM1Q8N682 238 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DUX5Q96PT3 197 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 S1PR2O95136 353 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF90Q03938 601 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PRR27Q6MZM9 219 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 LYZL4Q96KX0 146 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C16orf92Q96LL3 132 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 Q96MF0 132 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TUBA4BQ9H853 241 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 FBXL17Q9UF56 701 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GPR132Q9UNW8 380 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF98A6NK75 572 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HLA-DQB1P01920 261 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NPPCP23582 126 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CD1BP29016 333 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TM4SF20Q53R12 229 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 FAM78BQ5VT40 261 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.7□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C20orf202A1L168 122 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 AP4M1O00189 453 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 VMO1Q7Z5L0 202 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 VOPP1Q96AW1 172 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SPRY4Q9C004 299 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TOLLIPQ9H0E2 274 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NAGKQ9UJ70 344 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MOB4Q9Y3A3 225 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DENND4CQ5VZ89 1909 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TSPOP30536 169 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PAX5Q02548 391 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 H1FOOQ8IZA3 346 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GSX2Q9BZM3 304 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CACNA1GO43497 2377 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 IGHV3-21A0A0B4J1V1 117 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RNF223E7ERA6 249 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MSMBP08118 114 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CCL3L1P16619 93 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM41BQ5BJD5 291 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HMSDA8MTL9 139 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ADAM10O14672 748 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 LILRA1O75019 489 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 UQCRFS1P47985 274 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 GNG4P50150 75 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM177Q53S58 311 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF497Q6ZNH5 498 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 OVCH2Q7RTZ1 564 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RXFP4Q8TDU9 374 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 BPESC1Q9GZL8 116 aa6.69□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HTTP42858 3142 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PSG9Q00887 426 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RPL39P5Q59GN2 51 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 FBXL15Q9H469 300 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RBKSQ9H477 322 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TCF19Q9Y242 345 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DKK1O94907 266 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 CXorf1O96002 111 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MYOD1P15172 320 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RND3P61587 244 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ANKRD55Q3KP44 614 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 OR10S1Q8NGN2 331 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RPL7P18124 248 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PSG5Q15238 335 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 DPPA3Q6W0C5 159 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 BPIFA4PQ86YQ2 179 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 ZNF525Q8N782 197 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PHYHIPLQ96FC7 376 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RNF5Q99942 180 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 COL4A3Q01955 1670 aa6.68□□□□□ -1.34
NANOG-201ENST00000229307 PITX3O75364 302 aa6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms