RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001711.5

Hoxc6-201, Transcript of Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxc6, Length 1,581 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Btbd35f30J3QML3 498 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Erdr1J3QMM0 206 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Btbd35f22J3QN64 498 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr92L7N475 312 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Amy1P00687 511 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr143P34985 313 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vgll3P85442 326 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Q32P12 615 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spin2cQ6NVE3 257 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Flrt1Q6RKD8 674 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mitd1Q8VDV8 249 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1420Q8VF55 309 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr52Q8VFL0 319 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1446Q8VFX4 308 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1408Q8VG32 310 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Flywch2Q9CQE9 139 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hmg20aQ9DC33 346 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Slc2a8Q9JIF3 477 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tex101Q9JMI7 250 aa15.4■□□□□ 0.06
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm7849D3YX03 116 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm11009F7CWA7 138 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 MyadmO35682 320 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fgf2P15655 154 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Hist1h1dP43277 221 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Rims4P60191 269 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gng2P63213 71 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gfra1P97785 468 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccdc190Q3URK1 288 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Adh7Q64437 374 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Smim12Q78RX3 92 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr598Q7TRR2 319 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr314Q7TRZ7 330 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pxdc1Q8JZU6 231 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Fn3krpQ8K274 309 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 H1fooQ8VIK3 304 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 D6Wsu163eQ91YN0 552 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Immp1lQ9CQU8 166 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prss37Q9DAA4 237 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vmn1r47Q9EQ51 310 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Syt7Q9R0N7 403 aa15.39■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ighv1-81A0A075B5Y4 117 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm8212F6ZMY5 213 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mex3aG3UYU0 520 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Scd2P13011 358 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Htr2aP35363 471 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Malt1Q2TBA3 832 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Foxf1Q61080 378 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp85Q7TMC9 473 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lrrc75aQ7TSF4 339 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Tex36Q9D5N9 219 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abca2P41234 2434 aa15.38■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spink14B9EJP9 96 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm6594J3QM43 95 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vmn2r58K7N6V2 862 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gng8P63078 70 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Spink6Q8BT20 105 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr344Q8VFP9 309 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr202Q8VGQ3 307 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Exosc4Q921I9 245 aaKnown RBP15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sntg1Q925E1 517 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Nudcd2Q9CQ48 157 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dph7Q9CYU6 477 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prkar1aQ9DBC7 381 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dscaml1Q4VA61 2053 aa15.37■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Lnp1A0A1B0GSK3 178 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 FggyA2AJL3 552 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm15114B1B0X6 433 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Sirpb1cK7N6K7 397 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 RelP15307 587 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Neurog3P70661 214 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Anxa7Q07076 463 aaKnown RBP15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr517Q7TRU4 314 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm9758Q80ZT2 255 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Actbl2Q8BFZ3 376 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Vrk3Q8K3G5 453 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr559Q8VH14 318 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gorasp2Q99JX3 451 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Abhd5Q9DBL9 351 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Trav15d-1-dv6d-1A0A075B624 124 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1700031F05RikB1AX30 191 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arxes1C0HK79 180 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Arxes2C0HK80 180 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Iqcf6G3UWF2 157 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 E030018B13RikJ3QMS9 113 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifna9P09235 190 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Pdp1Q3UV70 538 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 XkrxQ5GH68 449 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ifna15Q61718 190 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mapk3Q63844 380 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Zfp663Q6NXM6 656 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ccsmst1Q6RUT7 136 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm26558Q8BLW8 286 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Mrps24Q9CQV5 167 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ndufb7Q9CR61 137 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Prr30Q9D9B7 401 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Alg5Q9DB25 324 aa15.36■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Dido1Q8C9B9 2256 aaKnown RBP15.35■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Olfr1274-psA0A1L1SQ02 309 aa15.35■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa15.35■□□□□ 0.05
Hoxc6-201ENSMUST00000001711 Gm4884E9PVP9 694 aa15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.4 ms