RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626583.2

LINC01828-208, Transcript of long intergenic non-protein coding RNA 1828, human

TSL 5

Gene LINC01828, Length 848 nt, Biotype lincRNA.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF292	O60281	2723 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	USP24	Q9UPU5	2620 aa		5.1	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	SNED1	Q8TER0	1413 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	DDX11L8	A8MPP1	907 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	ADM5	C9JUS6	153 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	PPFIA3	O75145	1194 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	SERPINB2	P05120	415 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	HMGB2	P26583	209 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	GPAT2	Q6NUI2	795 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	MOB2	Q70IA6	237 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	ADARB2	Q9NS39	739 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	GPRC5D	Q9NZD1	345 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	ACACB	O00763	2458 aa		5.09	□□□□□ -1.59
LINC01828-208	ENST00000626583	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		5.09	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SEMA3E	O15041	775 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SLC51A	Q86UW1	340 aa		5.08	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KLF16	Q9BXK1	252 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	CYP27B1	O15528	508 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ARHGEF15	O94989	841 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SLURP2	P0DP57	97 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KRT76	Q01546	638 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNH5	Q8NCM2	988 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	NANOS1	Q8WY41	292 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	LTV1	Q96GA3	475 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	PSMG3-AS1	Q96PY0	264 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	EFCC1	Q9HA90	598 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ATG3	Q9NT62	314 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	LTBP2	Q14767	1821 aa		5.07	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ZFHX2	Q9C0A1	2572 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ADH1C	P00326	375 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	TIMP2	P16035	220 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	JUND	P17535	347 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	USP46	P62068	366 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	PPM1E	Q8WY54	764 aa		5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	COL4A6	Q14031	1691 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	COL15A1	P39059	1388 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	EGFR	P00533	1210 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	GJA8	P48165	433 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	EIF6	P56537	245 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	MRPS5	P82675	430 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	CCDC93	Q567U6	631 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	NBPF11	Q86T75	865 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	THEG	Q9P2T0	379 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	FAM186A	A6NE01	2351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		5.05	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SH3BP2	P78314	561 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KRT26	Q7Z3Y9	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	ERO1A	Q96HE7	468 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	CD163L1	Q9NR16	1453 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	MGAM	O43451	1857 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		5.04	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	TTC21B	Q7Z4L5	1316 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	GPR37	O15354	613 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SRGN	P10124	158 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	CD46	P15529	392 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	IRS1	P35568	1242 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KCNQ1	P51787	676 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	NNT	Q13423	1086 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	NLRP7	Q8WX94	980 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	GBF1	Q92538	1859 aa		5.03	□□□□□ -1.6
LINC01828-208	ENST00000626583	SCN7A	Q01118	1682 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	RIF1	Q5UIP0	2472 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	PRR33	A8MZF0	331 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	MSTN	O14793	375 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	MAN1A2	O60476	641 aa		5.02	□□□□□ -1.61
LINC01828-208	ENST00000626583	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61

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